Protein–RNA interactions for Protein: A2A9G7

Shisal2a, Protein shisa-like-2A, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisal2aA2A9G7 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Shisal2aA2A9G7 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Shisal2aA2A9G7 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Shisal2aA2A9G7 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Shisal2aA2A9G7 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Shisal2aA2A9G7 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Shisal2aA2A9G7 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Shisal2aA2A9G7 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Shisal2aA2A9G7 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Shisal2aA2A9G7 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Shisal2aA2A9G7 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Shisal2aA2A9G7 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Shisal2aA2A9G7 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Shisal2aA2A9G7 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Shisal2aA2A9G7 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Shisal2aA2A9G7 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Shisal2aA2A9G7 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Shisal2aA2A9G7 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Shisal2aA2A9G7 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Shisal2aA2A9G7 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Shisal2aA2A9G7 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Shisal2aA2A9G7 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Shisal2aA2A9G7 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Shisal2aA2A9G7 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Shisal2aA2A9G7 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Shisal2aA2A9G7 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Shisal2aA2A9G7 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Shisal2aA2A9G7 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Shisal2aA2A9G7 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Shisal2aA2A9G7 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Shisal2aA2A9G7 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Shisal2aA2A9G7 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Shisal2aA2A9G7 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Shisal2aA2A9G7 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Shisal2aA2A9G7 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Shisal2aA2A9G7 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Shisal2aA2A9G7 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Shisal2aA2A9G7 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Shisal2aA2A9G7 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Shisal2aA2A9G7 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Shisal2aA2A9G7 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Shisal2aA2A9G7 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Shisal2aA2A9G7 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Shisal2aA2A9G7 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Shisal2aA2A9G7 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Shisal2aA2A9G7 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Shisal2aA2A9G7 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Shisal2aA2A9G7 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Shisal2aA2A9G7 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Shisal2aA2A9G7 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Shisal2aA2A9G7 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Shisal2aA2A9G7 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Shisal2aA2A9G7 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Shisal2aA2A9G7 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Shisal2aA2A9G7 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Shisal2aA2A9G7 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Shisal2aA2A9G7 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Shisal2aA2A9G7 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Shisal2aA2A9G7 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Shisal2aA2A9G7 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Shisal2aA2A9G7 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Shisal2aA2A9G7 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Shisal2aA2A9G7 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Shisal2aA2A9G7 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Shisal2aA2A9G7 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Shisal2aA2A9G7 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Shisal2aA2A9G7 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Shisal2aA2A9G7 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Shisal2aA2A9G7 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Shisal2aA2A9G7 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Shisal2aA2A9G7 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Shisal2aA2A9G7 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Shisal2aA2A9G7 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Shisal2aA2A9G7 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Shisal2aA2A9G7 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Shisal2aA2A9G7 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Shisal2aA2A9G7 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Shisal2aA2A9G7 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Shisal2aA2A9G7 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Shisal2aA2A9G7 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Shisal2aA2A9G7 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Shisal2aA2A9G7 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Shisal2aA2A9G7 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Shisal2aA2A9G7 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Shisal2aA2A9G7 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Shisal2aA2A9G7 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Shisal2aA2A9G7 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Shisal2aA2A9G7 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Shisal2aA2A9G7 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Shisal2aA2A9G7 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Shisal2aA2A9G7 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Shisal2aA2A9G7 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Shisal2aA2A9G7 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Shisal2aA2A9G7 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Shisal2aA2A9G7 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Shisal2aA2A9G7 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Shisal2aA2A9G7 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Shisal2aA2A9G7 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Shisal2aA2A9G7 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Shisal2aA2A9G7 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms