Protein–RNA interactions for Protein: A2A8C4

Gm13040, Predicted gene 13040, mousemouse

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Length 496 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm13040A2A8C4 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm13040A2A8C4 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm13040A2A8C4 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm13040A2A8C4 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm13040A2A8C4 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm13040A2A8C4 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm13040A2A8C4 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm13040A2A8C4 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm13040A2A8C4 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm13040A2A8C4 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm13040A2A8C4 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm13040A2A8C4 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm13040A2A8C4 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm13040A2A8C4 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm13040A2A8C4 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm13040A2A8C4 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm13040A2A8C4 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm13040A2A8C4 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm13040A2A8C4 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm13040A2A8C4 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm13040A2A8C4 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm13040A2A8C4 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm13040A2A8C4 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm13040A2A8C4 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm13040A2A8C4 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm13040A2A8C4 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm13040A2A8C4 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm13040A2A8C4 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm13040A2A8C4 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm13040A2A8C4 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm13040A2A8C4 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm13040A2A8C4 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm13040A2A8C4 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm13040A2A8C4 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm13040A2A8C4 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm13040A2A8C4 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm13040A2A8C4 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm13040A2A8C4 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm13040A2A8C4 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm13040A2A8C4 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm13040A2A8C4 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm13040A2A8C4 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm13040A2A8C4 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm13040A2A8C4 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm13040A2A8C4 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm13040A2A8C4 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm13040A2A8C4 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm13040A2A8C4 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm13040A2A8C4 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm13040A2A8C4 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm13040A2A8C4 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm13040A2A8C4 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm13040A2A8C4 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm13040A2A8C4 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm13040A2A8C4 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm13040A2A8C4 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm13040A2A8C4 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm13040A2A8C4 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm13040A2A8C4 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm13040A2A8C4 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm13040A2A8C4 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm13040A2A8C4 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm13040A2A8C4 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm13040A2A8C4 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm13040A2A8C4 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm13040A2A8C4 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm13040A2A8C4 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm13040A2A8C4 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm13040A2A8C4 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm13040A2A8C4 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm13040A2A8C4 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm13040A2A8C4 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm13040A2A8C4 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm13040A2A8C4 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm13040A2A8C4 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm13040A2A8C4 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm13040A2A8C4 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm13040A2A8C4 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm13040A2A8C4 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm13040A2A8C4 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm13040A2A8C4 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm13040A2A8C4 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm13040A2A8C4 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm13040A2A8C4 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm13040A2A8C4 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm13040A2A8C4 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm13040A2A8C4 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm13040A2A8C4 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm13040A2A8C4 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm13040A2A8C4 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm13040A2A8C4 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm13040A2A8C4 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm13040A2A8C4 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm13040A2A8C4 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm13040A2A8C4 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm13040A2A8C4 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm13040A2A8C4 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm13040A2A8C4 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm13040A2A8C4 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm13040A2A8C4 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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