Protein–RNA interactions for Protein: A2A6M5

Calcoco2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calcoco2A2A6M5 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Calcoco2A2A6M5 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Calcoco2A2A6M5 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Calcoco2A2A6M5 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Calcoco2A2A6M5 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Calcoco2A2A6M5 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Calcoco2A2A6M5 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Calcoco2A2A6M5 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Calcoco2A2A6M5 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Calcoco2A2A6M5 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Calcoco2A2A6M5 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Calcoco2A2A6M5 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Calcoco2A2A6M5 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Calcoco2A2A6M5 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Calcoco2A2A6M5 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Calcoco2A2A6M5 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Calcoco2A2A6M5 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Calcoco2A2A6M5 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Calcoco2A2A6M5 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Calcoco2A2A6M5 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Calcoco2A2A6M5 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Calcoco2A2A6M5 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Calcoco2A2A6M5 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Calcoco2A2A6M5 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Calcoco2A2A6M5 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Calcoco2A2A6M5 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Calcoco2A2A6M5 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Calcoco2A2A6M5 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Calcoco2A2A6M5 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Calcoco2A2A6M5 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Calcoco2A2A6M5 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Calcoco2A2A6M5 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Calcoco2A2A6M5 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Calcoco2A2A6M5 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Calcoco2A2A6M5 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Calcoco2A2A6M5 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Calcoco2A2A6M5 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Calcoco2A2A6M5 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Calcoco2A2A6M5 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Calcoco2A2A6M5 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Calcoco2A2A6M5 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Calcoco2A2A6M5 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Calcoco2A2A6M5 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Calcoco2A2A6M5 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Calcoco2A2A6M5 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Calcoco2A2A6M5 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Calcoco2A2A6M5 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Calcoco2A2A6M5 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Calcoco2A2A6M5 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Calcoco2A2A6M5 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Calcoco2A2A6M5 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Calcoco2A2A6M5 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Calcoco2A2A6M5 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Calcoco2A2A6M5 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Calcoco2A2A6M5 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Calcoco2A2A6M5 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Calcoco2A2A6M5 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Calcoco2A2A6M5 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Calcoco2A2A6M5 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Calcoco2A2A6M5 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Calcoco2A2A6M5 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Calcoco2A2A6M5 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Calcoco2A2A6M5 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Calcoco2A2A6M5 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Calcoco2A2A6M5 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Calcoco2A2A6M5 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Calcoco2A2A6M5 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Calcoco2A2A6M5 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Calcoco2A2A6M5 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Calcoco2A2A6M5 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Calcoco2A2A6M5 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Calcoco2A2A6M5 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Calcoco2A2A6M5 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Calcoco2A2A6M5 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Calcoco2A2A6M5 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Calcoco2A2A6M5 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Calcoco2A2A6M5 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Calcoco2A2A6M5 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Calcoco2A2A6M5 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Calcoco2A2A6M5 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Calcoco2A2A6M5 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Calcoco2A2A6M5 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Calcoco2A2A6M5 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Calcoco2A2A6M5 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Calcoco2A2A6M5 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Calcoco2A2A6M5 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Calcoco2A2A6M5 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Calcoco2A2A6M5 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Calcoco2A2A6M5 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Calcoco2A2A6M5 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Calcoco2A2A6M5 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Calcoco2A2A6M5 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Calcoco2A2A6M5 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Calcoco2A2A6M5 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Calcoco2A2A6M5 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Calcoco2A2A6M5 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Calcoco2A2A6M5 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Calcoco2A2A6M5 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Calcoco2A2A6M5 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Calcoco2A2A6M5 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms