Protein–RNA interactions for Protein: A2A5X4

Krtap29-1, Keratin-associated protein 29-1, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap29-1A2A5X4 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Krtap29-1A2A5X4 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Krtap29-1A2A5X4 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Krtap29-1A2A5X4 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Krtap29-1A2A5X4 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Krtap29-1A2A5X4 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Krtap29-1A2A5X4 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Krtap29-1A2A5X4 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Krtap29-1A2A5X4 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Krtap29-1A2A5X4 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Krtap29-1A2A5X4 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Krtap29-1A2A5X4 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Krtap29-1A2A5X4 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Krtap29-1A2A5X4 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Krtap29-1A2A5X4 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Krtap29-1A2A5X4 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Krtap29-1A2A5X4 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Krtap29-1A2A5X4 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Krtap29-1A2A5X4 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Krtap29-1A2A5X4 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Krtap29-1A2A5X4 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Krtap29-1A2A5X4 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Krtap29-1A2A5X4 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Krtap29-1A2A5X4 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Krtap29-1A2A5X4 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Krtap29-1A2A5X4 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Krtap29-1A2A5X4 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Krtap29-1A2A5X4 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Krtap29-1A2A5X4 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Krtap29-1A2A5X4 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Krtap29-1A2A5X4 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Krtap29-1A2A5X4 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Krtap29-1A2A5X4 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Krtap29-1A2A5X4 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Krtap29-1A2A5X4 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Krtap29-1A2A5X4 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Krtap29-1A2A5X4 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Krtap29-1A2A5X4 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Krtap29-1A2A5X4 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Krtap29-1A2A5X4 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Krtap29-1A2A5X4 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Krtap29-1A2A5X4 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Krtap29-1A2A5X4 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Krtap29-1A2A5X4 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Krtap29-1A2A5X4 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Krtap29-1A2A5X4 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Krtap29-1A2A5X4 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Krtap29-1A2A5X4 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Krtap29-1A2A5X4 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Krtap29-1A2A5X4 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Krtap29-1A2A5X4 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Krtap29-1A2A5X4 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Krtap29-1A2A5X4 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Krtap29-1A2A5X4 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Krtap29-1A2A5X4 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Krtap29-1A2A5X4 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Krtap29-1A2A5X4 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Krtap29-1A2A5X4 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Krtap29-1A2A5X4 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Krtap29-1A2A5X4 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Krtap29-1A2A5X4 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Krtap29-1A2A5X4 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Krtap29-1A2A5X4 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Krtap29-1A2A5X4 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Krtap29-1A2A5X4 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Krtap29-1A2A5X4 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Krtap29-1A2A5X4 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
Krtap29-1A2A5X4 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Krtap29-1A2A5X4 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
Krtap29-1A2A5X4 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
Krtap29-1A2A5X4 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Krtap29-1A2A5X4 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Krtap29-1A2A5X4 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Krtap29-1A2A5X4 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Krtap29-1A2A5X4 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Krtap29-1A2A5X4 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Krtap29-1A2A5X4 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Krtap29-1A2A5X4 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
Krtap29-1A2A5X4 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Krtap29-1A2A5X4 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Krtap29-1A2A5X4 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Krtap29-1A2A5X4 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Krtap29-1A2A5X4 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Krtap29-1A2A5X4 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Krtap29-1A2A5X4 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Krtap29-1A2A5X4 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Krtap29-1A2A5X4 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Krtap29-1A2A5X4 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Krtap29-1A2A5X4 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Krtap29-1A2A5X4 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Krtap29-1A2A5X4 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Krtap29-1A2A5X4 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Krtap29-1A2A5X4 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Krtap29-1A2A5X4 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Krtap29-1A2A5X4 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Krtap29-1A2A5X4 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Krtap29-1A2A5X4 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Krtap29-1A2A5X4 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Krtap29-1A2A5X4 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Krtap29-1A2A5X4 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms