Protein–RNA interactions for Protein: A0A0R4J054

4921501E09Rik, RIKEN cDNA 4921501E09, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4921501E09RikA0A0R4J054 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4921501E09RikA0A0R4J054 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4921501E09RikA0A0R4J054 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4921501E09RikA0A0R4J054 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4921501E09RikA0A0R4J054 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4921501E09RikA0A0R4J054 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
4921501E09RikA0A0R4J054 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4921501E09RikA0A0R4J054 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4921501E09RikA0A0R4J054 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4921501E09RikA0A0R4J054 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4921501E09RikA0A0R4J054 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4921501E09RikA0A0R4J054 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4921501E09RikA0A0R4J054 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
4921501E09RikA0A0R4J054 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4921501E09RikA0A0R4J054 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4921501E09RikA0A0R4J054 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4921501E09RikA0A0R4J054 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4921501E09RikA0A0R4J054 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4921501E09RikA0A0R4J054 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4921501E09RikA0A0R4J054 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
4921501E09RikA0A0R4J054 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4921501E09RikA0A0R4J054 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
4921501E09RikA0A0R4J054 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
4921501E09RikA0A0R4J054 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4921501E09RikA0A0R4J054 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4921501E09RikA0A0R4J054 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
4921501E09RikA0A0R4J054 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4921501E09RikA0A0R4J054 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4921501E09RikA0A0R4J054 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4921501E09RikA0A0R4J054 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4921501E09RikA0A0R4J054 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4921501E09RikA0A0R4J054 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4921501E09RikA0A0R4J054 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4921501E09RikA0A0R4J054 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4921501E09RikA0A0R4J054 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
4921501E09RikA0A0R4J054 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
4921501E09RikA0A0R4J054 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4921501E09RikA0A0R4J054 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
4921501E09RikA0A0R4J054 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4921501E09RikA0A0R4J054 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4921501E09RikA0A0R4J054 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4921501E09RikA0A0R4J054 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4921501E09RikA0A0R4J054 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4921501E09RikA0A0R4J054 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4921501E09RikA0A0R4J054 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
4921501E09RikA0A0R4J054 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4921501E09RikA0A0R4J054 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4921501E09RikA0A0R4J054 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
4921501E09RikA0A0R4J054 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4921501E09RikA0A0R4J054 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4921501E09RikA0A0R4J054 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
4921501E09RikA0A0R4J054 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
4921501E09RikA0A0R4J054 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
4921501E09RikA0A0R4J054 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4921501E09RikA0A0R4J054 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4921501E09RikA0A0R4J054 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4921501E09RikA0A0R4J054 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4921501E09RikA0A0R4J054 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4921501E09RikA0A0R4J054 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4921501E09RikA0A0R4J054 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4921501E09RikA0A0R4J054 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
4921501E09RikA0A0R4J054 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
4921501E09RikA0A0R4J054 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
4921501E09RikA0A0R4J054 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
4921501E09RikA0A0R4J054 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4921501E09RikA0A0R4J054 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4921501E09RikA0A0R4J054 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
4921501E09RikA0A0R4J054 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4921501E09RikA0A0R4J054 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
4921501E09RikA0A0R4J054 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4921501E09RikA0A0R4J054 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4921501E09RikA0A0R4J054 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4921501E09RikA0A0R4J054 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
4921501E09RikA0A0R4J054 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
4921501E09RikA0A0R4J054 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4921501E09RikA0A0R4J054 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4921501E09RikA0A0R4J054 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4921501E09RikA0A0R4J054 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
4921501E09RikA0A0R4J054 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
4921501E09RikA0A0R4J054 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
4921501E09RikA0A0R4J054 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4921501E09RikA0A0R4J054 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4921501E09RikA0A0R4J054 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4921501E09RikA0A0R4J054 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4921501E09RikA0A0R4J054 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4921501E09RikA0A0R4J054 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4921501E09RikA0A0R4J054 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4921501E09RikA0A0R4J054 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4921501E09RikA0A0R4J054 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4921501E09RikA0A0R4J054 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4921501E09RikA0A0R4J054 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4921501E09RikA0A0R4J054 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
4921501E09RikA0A0R4J054 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms