Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1P8

Trbv13-1, T cell receptor beta, variable 13-1 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trbv13-1A0A0B4J1P8 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trbv13-1A0A0B4J1P8 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trbv13-1A0A0B4J1P8 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trbv13-1A0A0B4J1P8 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trbv13-1A0A0B4J1P8 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trbv13-1A0A0B4J1P8 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trbv13-1A0A0B4J1P8 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trbv13-1A0A0B4J1P8 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trbv13-1A0A0B4J1P8 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Trbv13-1A0A0B4J1P8 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trbv13-1A0A0B4J1P8 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trbv13-1A0A0B4J1P8 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trbv13-1A0A0B4J1P8 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms