Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP7

Gm3238, MCG61407, mousemouse

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3238W4VSP7 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3238W4VSP7 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3238W4VSP7 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3238W4VSP7 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3238W4VSP7 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3238W4VSP7 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3238W4VSP7 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3238W4VSP7 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3238W4VSP7 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3238W4VSP7 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3238W4VSP7 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3238W4VSP7 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3238W4VSP7 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3238W4VSP7 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3238W4VSP7 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3238W4VSP7 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3238W4VSP7 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3238W4VSP7 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3238W4VSP7 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3238W4VSP7 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3238W4VSP7 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3238W4VSP7 Gm14201-201ENSMUST00000117627 289 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3238W4VSP7 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3238W4VSP7 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3238W4VSP7 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3238W4VSP7 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3238W4VSP7 Gm10012-202ENSMUST00000170379 372 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3238W4VSP7 Gm27861-201ENSMUST00000183920 214 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3238W4VSP7 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3238W4VSP7 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3238W4VSP7 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3238W4VSP7 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3238W4VSP7 Gm38018-201ENSMUST00000195651 540 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3238W4VSP7 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3238W4VSP7 Gm42556-201ENSMUST00000201397 607 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3238W4VSP7 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3238W4VSP7 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3238W4VSP7 Gm15396-201ENSMUST00000209101 1089 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3238W4VSP7 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3238W4VSP7 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
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Gm3238W4VSP7 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3238W4VSP7 Tnfsf9-201ENSMUST00000039490 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3238W4VSP7 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Gm3238W4VSP7 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3238W4VSP7 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3238W4VSP7 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3238W4VSP7 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3238W4VSP7 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3238W4VSP7 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3238W4VSP7 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3238W4VSP7 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3238W4VSP7 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3238W4VSP7 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3238W4VSP7 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3238W4VSP7 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3238W4VSP7 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3238W4VSP7 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3238W4VSP7 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3238W4VSP7 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3238W4VSP7 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3238W4VSP7 Amelx-204ENSMUST00000112120 727 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3238W4VSP7 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3238W4VSP7 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Gm3238W4VSP7 1700051K13Rik-201ENSMUST00000204426 696 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
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Gm3238W4VSP7 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3238W4VSP7 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3238W4VSP7 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3238W4VSP7 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3238W4VSP7 Olfr196-201ENSMUST00000077027 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3238W4VSP7 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3238W4VSP7 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3238W4VSP7 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3238W4VSP7 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3238W4VSP7 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3238W4VSP7 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3238W4VSP7 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3238W4VSP7 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3238W4VSP7 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3238W4VSP7 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3238W4VSP7 A430018G15Rik-201ENSMUST00000124210 1314 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3238W4VSP7 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3238W4VSP7 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3238W4VSP7 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3238W4VSP7 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3238W4VSP7 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3238W4VSP7 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3238W4VSP7 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3238W4VSP7 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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