Protein–RNA interactions for Protein: T1NXB5

Vstm4, V-set and transmembrane domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm4T1NXB5 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vstm4T1NXB5 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vstm4T1NXB5 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vstm4T1NXB5 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vstm4T1NXB5 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Vstm4T1NXB5 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vstm4T1NXB5 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vstm4T1NXB5 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vstm4T1NXB5 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vstm4T1NXB5 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vstm4T1NXB5 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vstm4T1NXB5 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vstm4T1NXB5 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vstm4T1NXB5 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Vstm4T1NXB5 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vstm4T1NXB5 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vstm4T1NXB5 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vstm4T1NXB5 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vstm4T1NXB5 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vstm4T1NXB5 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vstm4T1NXB5 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vstm4T1NXB5 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vstm4T1NXB5 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vstm4T1NXB5 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vstm4T1NXB5 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vstm4T1NXB5 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vstm4T1NXB5 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vstm4T1NXB5 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vstm4T1NXB5 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vstm4T1NXB5 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vstm4T1NXB5 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vstm4T1NXB5 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vstm4T1NXB5 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vstm4T1NXB5 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vstm4T1NXB5 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vstm4T1NXB5 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vstm4T1NXB5 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vstm4T1NXB5 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vstm4T1NXB5 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vstm4T1NXB5 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vstm4T1NXB5 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vstm4T1NXB5 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vstm4T1NXB5 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Vstm4T1NXB5 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vstm4T1NXB5 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vstm4T1NXB5 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vstm4T1NXB5 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vstm4T1NXB5 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vstm4T1NXB5 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vstm4T1NXB5 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vstm4T1NXB5 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vstm4T1NXB5 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vstm4T1NXB5 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vstm4T1NXB5 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vstm4T1NXB5 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vstm4T1NXB5 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vstm4T1NXB5 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vstm4T1NXB5 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vstm4T1NXB5 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vstm4T1NXB5 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vstm4T1NXB5 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vstm4T1NXB5 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vstm4T1NXB5 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vstm4T1NXB5 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vstm4T1NXB5 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vstm4T1NXB5 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vstm4T1NXB5 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vstm4T1NXB5 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vstm4T1NXB5 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vstm4T1NXB5 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vstm4T1NXB5 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vstm4T1NXB5 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vstm4T1NXB5 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vstm4T1NXB5 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vstm4T1NXB5 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Vstm4T1NXB5 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vstm4T1NXB5 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vstm4T1NXB5 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vstm4T1NXB5 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vstm4T1NXB5 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vstm4T1NXB5 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vstm4T1NXB5 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vstm4T1NXB5 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vstm4T1NXB5 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vstm4T1NXB5 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vstm4T1NXB5 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vstm4T1NXB5 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vstm4T1NXB5 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vstm4T1NXB5 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vstm4T1NXB5 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vstm4T1NXB5 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vstm4T1NXB5 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vstm4T1NXB5 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vstm4T1NXB5 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Vstm4T1NXB5 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vstm4T1NXB5 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vstm4T1NXB5 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vstm4T1NXB5 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vstm4T1NXB5 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vstm4T1NXB5 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms