Protein–RNA interactions for Protein: S4R1M3

H2afb2, Histone H2A, mousemouse

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afb2S4R1M3 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2afb2S4R1M3 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2afb2S4R1M3 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2afb2S4R1M3 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2afb2S4R1M3 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2afb2S4R1M3 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2afb2S4R1M3 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2afb2S4R1M3 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
H2afb2S4R1M3 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2afb2S4R1M3 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2afb2S4R1M3 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2afb2S4R1M3 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2afb2S4R1M3 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2afb2S4R1M3 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2afb2S4R1M3 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
H2afb2S4R1M3 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2afb2S4R1M3 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2afb2S4R1M3 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2afb2S4R1M3 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2afb2S4R1M3 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2afb2S4R1M3 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2afb2S4R1M3 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2afb2S4R1M3 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2afb2S4R1M3 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2afb2S4R1M3 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2afb2S4R1M3 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2afb2S4R1M3 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2afb2S4R1M3 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2afb2S4R1M3 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2afb2S4R1M3 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2afb2S4R1M3 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2afb2S4R1M3 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2afb2S4R1M3 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2afb2S4R1M3 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2afb2S4R1M3 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2afb2S4R1M3 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2afb2S4R1M3 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2afb2S4R1M3 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2afb2S4R1M3 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2afb2S4R1M3 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2afb2S4R1M3 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
H2afb2S4R1M3 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2afb2S4R1M3 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
H2afb2S4R1M3 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
H2afb2S4R1M3 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2afb2S4R1M3 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
H2afb2S4R1M3 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2afb2S4R1M3 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2afb2S4R1M3 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2afb2S4R1M3 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2afb2S4R1M3 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2afb2S4R1M3 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2afb2S4R1M3 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2afb2S4R1M3 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2afb2S4R1M3 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2afb2S4R1M3 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2afb2S4R1M3 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2afb2S4R1M3 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2afb2S4R1M3 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2afb2S4R1M3 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2afb2S4R1M3 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2afb2S4R1M3 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2afb2S4R1M3 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
H2afb2S4R1M3 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
H2afb2S4R1M3 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
H2afb2S4R1M3 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
H2afb2S4R1M3 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
H2afb2S4R1M3 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
H2afb2S4R1M3 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
H2afb2S4R1M3 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
H2afb2S4R1M3 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2afb2S4R1M3 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2afb2S4R1M3 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2afb2S4R1M3 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2afb2S4R1M3 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2afb2S4R1M3 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2afb2S4R1M3 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2afb2S4R1M3 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
H2afb2S4R1M3 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
H2afb2S4R1M3 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2afb2S4R1M3 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2afb2S4R1M3 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2afb2S4R1M3 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2afb2S4R1M3 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2afb2S4R1M3 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2afb2S4R1M3 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2afb2S4R1M3 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2afb2S4R1M3 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2afb2S4R1M3 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2afb2S4R1M3 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2afb2S4R1M3 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2afb2S4R1M3 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2afb2S4R1M3 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2afb2S4R1M3 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2afb2S4R1M3 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2afb2S4R1M3 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2afb2S4R1M3 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2afb2S4R1M3 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2afb2S4R1M3 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2afb2S4R1M3 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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