Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z331

Krt6b, Keratin, type II cytoskeletal 6B, mousemouse

Predictions only

Length 562 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt6bQ9Z331 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt6bQ9Z331 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt6bQ9Z331 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt6bQ9Z331 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt6bQ9Z331 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt6bQ9Z331 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt6bQ9Z331 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt6bQ9Z331 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt6bQ9Z331 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt6bQ9Z331 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt6bQ9Z331 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt6bQ9Z331 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt6bQ9Z331 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt6bQ9Z331 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt6bQ9Z331 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt6bQ9Z331 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt6bQ9Z331 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt6bQ9Z331 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt6bQ9Z331 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt6bQ9Z331 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt6bQ9Z331 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt6bQ9Z331 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt6bQ9Z331 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt6bQ9Z331 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt6bQ9Z331 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt6bQ9Z331 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt6bQ9Z331 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt6bQ9Z331 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt6bQ9Z331 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt6bQ9Z331 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt6bQ9Z331 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt6bQ9Z331 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt6bQ9Z331 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt6bQ9Z331 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt6bQ9Z331 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt6bQ9Z331 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt6bQ9Z331 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt6bQ9Z331 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt6bQ9Z331 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt6bQ9Z331 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt6bQ9Z331 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt6bQ9Z331 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt6bQ9Z331 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt6bQ9Z331 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt6bQ9Z331 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt6bQ9Z331 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt6bQ9Z331 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt6bQ9Z331 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt6bQ9Z331 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt6bQ9Z331 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt6bQ9Z331 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt6bQ9Z331 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt6bQ9Z331 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt6bQ9Z331 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt6bQ9Z331 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt6bQ9Z331 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt6bQ9Z331 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt6bQ9Z331 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt6bQ9Z331 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt6bQ9Z331 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt6bQ9Z331 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt6bQ9Z331 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt6bQ9Z331 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt6bQ9Z331 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt6bQ9Z331 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt6bQ9Z331 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt6bQ9Z331 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt6bQ9Z331 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt6bQ9Z331 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt6bQ9Z331 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt6bQ9Z331 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt6bQ9Z331 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt6bQ9Z331 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt6bQ9Z331 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt6bQ9Z331 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt6bQ9Z331 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt6bQ9Z331 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt6bQ9Z331 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt6bQ9Z331 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt6bQ9Z331 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt6bQ9Z331 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt6bQ9Z331 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt6bQ9Z331 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt6bQ9Z331 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt6bQ9Z331 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt6bQ9Z331 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt6bQ9Z331 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt6bQ9Z331 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt6bQ9Z331 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt6bQ9Z331 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt6bQ9Z331 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt6bQ9Z331 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt6bQ9Z331 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt6bQ9Z331 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt6bQ9Z331 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt6bQ9Z331 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt6bQ9Z331 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt6bQ9Z331 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt6bQ9Z331 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt6bQ9Z331 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms