Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z321

Top3b, DNA topoisomerase 3-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3bQ9Z321 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Top3bQ9Z321 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Top3bQ9Z321 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Top3bQ9Z321 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Top3bQ9Z321 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Top3bQ9Z321 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Top3bQ9Z321 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Top3bQ9Z321 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Top3bQ9Z321 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Top3bQ9Z321 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Top3bQ9Z321 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Top3bQ9Z321 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Top3bQ9Z321 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Top3bQ9Z321 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Top3bQ9Z321 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Top3bQ9Z321 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Top3bQ9Z321 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Top3bQ9Z321 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Top3bQ9Z321 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Top3bQ9Z321 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Top3bQ9Z321 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Top3bQ9Z321 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Top3bQ9Z321 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Top3bQ9Z321 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Top3bQ9Z321 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Top3bQ9Z321 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Top3bQ9Z321 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Top3bQ9Z321 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Top3bQ9Z321 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Top3bQ9Z321 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Top3bQ9Z321 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Top3bQ9Z321 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Top3bQ9Z321 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Top3bQ9Z321 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Top3bQ9Z321 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Top3bQ9Z321 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Top3bQ9Z321 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Top3bQ9Z321 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Top3bQ9Z321 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Top3bQ9Z321 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Top3bQ9Z321 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Top3bQ9Z321 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Top3bQ9Z321 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Top3bQ9Z321 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Top3bQ9Z321 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Top3bQ9Z321 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Top3bQ9Z321 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Top3bQ9Z321 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Top3bQ9Z321 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Top3bQ9Z321 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Top3bQ9Z321 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Top3bQ9Z321 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Top3bQ9Z321 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Top3bQ9Z321 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Top3bQ9Z321 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Top3bQ9Z321 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Top3bQ9Z321 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Top3bQ9Z321 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Top3bQ9Z321 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Top3bQ9Z321 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Top3bQ9Z321 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Top3bQ9Z321 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Top3bQ9Z321 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Top3bQ9Z321 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Top3bQ9Z321 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Top3bQ9Z321 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Top3bQ9Z321 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Top3bQ9Z321 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Top3bQ9Z321 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Top3bQ9Z321 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Top3bQ9Z321 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Top3bQ9Z321 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Top3bQ9Z321 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Top3bQ9Z321 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Top3bQ9Z321 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Top3bQ9Z321 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Top3bQ9Z321 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Top3bQ9Z321 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Top3bQ9Z321 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Top3bQ9Z321 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Top3bQ9Z321 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Top3bQ9Z321 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Top3bQ9Z321 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Top3bQ9Z321 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Top3bQ9Z321 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Top3bQ9Z321 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Top3bQ9Z321 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Top3bQ9Z321 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Top3bQ9Z321 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Top3bQ9Z321 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Top3bQ9Z321 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Top3bQ9Z321 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Top3bQ9Z321 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Top3bQ9Z321 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Top3bQ9Z321 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Top3bQ9Z321 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Top3bQ9Z321 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Top3bQ9Z321 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Top3bQ9Z321 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Top3bQ9Z321 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms