Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Y3

Homer1, Homer protein homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer1Q9Z2Y3 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
Homer1Q9Z2Y3 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Homer1Q9Z2Y3 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Homer1Q9Z2Y3 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Homer1Q9Z2Y3 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Homer1Q9Z2Y3 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Homer1Q9Z2Y3 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Homer1Q9Z2Y3 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Homer1Q9Z2Y3 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Homer1Q9Z2Y3 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Homer1Q9Z2Y3 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Homer1Q9Z2Y3 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Homer1Q9Z2Y3 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Homer1Q9Z2Y3 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Homer1Q9Z2Y3 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Homer1Q9Z2Y3 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Homer1Q9Z2Y3 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Homer1Q9Z2Y3 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Homer1Q9Z2Y3 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Homer1Q9Z2Y3 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Homer1Q9Z2Y3 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Homer1Q9Z2Y3 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Homer1Q9Z2Y3 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Homer1Q9Z2Y3 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Homer1Q9Z2Y3 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Homer1Q9Z2Y3 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Homer1Q9Z2Y3 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Homer1Q9Z2Y3 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Homer1Q9Z2Y3 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Homer1Q9Z2Y3 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Homer1Q9Z2Y3 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Homer1Q9Z2Y3 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Homer1Q9Z2Y3 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Homer1Q9Z2Y3 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Homer1Q9Z2Y3 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Homer1Q9Z2Y3 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Homer1Q9Z2Y3 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Homer1Q9Z2Y3 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Homer1Q9Z2Y3 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Homer1Q9Z2Y3 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Homer1Q9Z2Y3 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Homer1Q9Z2Y3 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Homer1Q9Z2Y3 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Homer1Q9Z2Y3 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Homer1Q9Z2Y3 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Homer1Q9Z2Y3 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Homer1Q9Z2Y3 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Homer1Q9Z2Y3 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Homer1Q9Z2Y3 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Homer1Q9Z2Y3 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Homer1Q9Z2Y3 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Homer1Q9Z2Y3 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Homer1Q9Z2Y3 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Homer1Q9Z2Y3 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Homer1Q9Z2Y3 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Homer1Q9Z2Y3 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Homer1Q9Z2Y3 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Homer1Q9Z2Y3 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Homer1Q9Z2Y3 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Homer1Q9Z2Y3 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Homer1Q9Z2Y3 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Homer1Q9Z2Y3 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Homer1Q9Z2Y3 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Homer1Q9Z2Y3 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Homer1Q9Z2Y3 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Homer1Q9Z2Y3 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Homer1Q9Z2Y3 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Homer1Q9Z2Y3 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Homer1Q9Z2Y3 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Homer1Q9Z2Y3 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Homer1Q9Z2Y3 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Homer1Q9Z2Y3 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Homer1Q9Z2Y3 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Homer1Q9Z2Y3 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Homer1Q9Z2Y3 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Homer1Q9Z2Y3 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Homer1Q9Z2Y3 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Homer1Q9Z2Y3 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Homer1Q9Z2Y3 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Homer1Q9Z2Y3 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Homer1Q9Z2Y3 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Homer1Q9Z2Y3 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Homer1Q9Z2Y3 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Homer1Q9Z2Y3 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Homer1Q9Z2Y3 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Homer1Q9Z2Y3 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Homer1Q9Z2Y3 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Homer1Q9Z2Y3 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Homer1Q9Z2Y3 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Homer1Q9Z2Y3 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Homer1Q9Z2Y3 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Homer1Q9Z2Y3 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Homer1Q9Z2Y3 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Homer1Q9Z2Y3 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Homer1Q9Z2Y3 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Homer1Q9Z2Y3 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Homer1Q9Z2Y3 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Homer1Q9Z2Y3 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Homer1Q9Z2Y3 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Homer1Q9Z2Y3 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms