Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q5

Mrpl40, 39S ribosomal protein L40, mitochondrial, mousemouse

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Length 206 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl40Q9Z2Q5 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Mrpl40Q9Z2Q5 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Mrpl40Q9Z2Q5 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Mrpl40Q9Z2Q5 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Mrpl40Q9Z2Q5 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Mrpl40Q9Z2Q5 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Mrpl40Q9Z2Q5 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Mrpl40Q9Z2Q5 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Mrpl40Q9Z2Q5 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Mrpl40Q9Z2Q5 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mrpl40Q9Z2Q5 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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