Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q2

Knop1, Lysine-rich nucleolar protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knop1Q9Z2Q2 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Knop1Q9Z2Q2 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Knop1Q9Z2Q2 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Knop1Q9Z2Q2 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Knop1Q9Z2Q2 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Knop1Q9Z2Q2 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Knop1Q9Z2Q2 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Knop1Q9Z2Q2 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Knop1Q9Z2Q2 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Knop1Q9Z2Q2 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Knop1Q9Z2Q2 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Knop1Q9Z2Q2 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Knop1Q9Z2Q2 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Knop1Q9Z2Q2 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Knop1Q9Z2Q2 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Knop1Q9Z2Q2 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Knop1Q9Z2Q2 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Knop1Q9Z2Q2 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Knop1Q9Z2Q2 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Knop1Q9Z2Q2 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Knop1Q9Z2Q2 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Knop1Q9Z2Q2 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Knop1Q9Z2Q2 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Knop1Q9Z2Q2 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Knop1Q9Z2Q2 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Knop1Q9Z2Q2 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Knop1Q9Z2Q2 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Knop1Q9Z2Q2 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Knop1Q9Z2Q2 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Knop1Q9Z2Q2 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Knop1Q9Z2Q2 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Knop1Q9Z2Q2 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Knop1Q9Z2Q2 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Knop1Q9Z2Q2 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Knop1Q9Z2Q2 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Knop1Q9Z2Q2 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Knop1Q9Z2Q2 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Knop1Q9Z2Q2 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Knop1Q9Z2Q2 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Knop1Q9Z2Q2 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Knop1Q9Z2Q2 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Knop1Q9Z2Q2 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Knop1Q9Z2Q2 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Knop1Q9Z2Q2 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Knop1Q9Z2Q2 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Knop1Q9Z2Q2 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Knop1Q9Z2Q2 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Knop1Q9Z2Q2 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Knop1Q9Z2Q2 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Knop1Q9Z2Q2 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Knop1Q9Z2Q2 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Knop1Q9Z2Q2 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Knop1Q9Z2Q2 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Knop1Q9Z2Q2 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Knop1Q9Z2Q2 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Knop1Q9Z2Q2 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Knop1Q9Z2Q2 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Knop1Q9Z2Q2 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Knop1Q9Z2Q2 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Knop1Q9Z2Q2 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Knop1Q9Z2Q2 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Knop1Q9Z2Q2 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Knop1Q9Z2Q2 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Knop1Q9Z2Q2 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Knop1Q9Z2Q2 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Knop1Q9Z2Q2 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Knop1Q9Z2Q2 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Knop1Q9Z2Q2 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Knop1Q9Z2Q2 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Knop1Q9Z2Q2 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Knop1Q9Z2Q2 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Knop1Q9Z2Q2 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Knop1Q9Z2Q2 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Knop1Q9Z2Q2 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Knop1Q9Z2Q2 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Knop1Q9Z2Q2 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Knop1Q9Z2Q2 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Knop1Q9Z2Q2 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Knop1Q9Z2Q2 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Knop1Q9Z2Q2 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Knop1Q9Z2Q2 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Knop1Q9Z2Q2 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Knop1Q9Z2Q2 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Knop1Q9Z2Q2 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Knop1Q9Z2Q2 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Knop1Q9Z2Q2 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Knop1Q9Z2Q2 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Knop1Q9Z2Q2 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Knop1Q9Z2Q2 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Knop1Q9Z2Q2 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Knop1Q9Z2Q2 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Knop1Q9Z2Q2 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Knop1Q9Z2Q2 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Knop1Q9Z2Q2 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Knop1Q9Z2Q2 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Knop1Q9Z2Q2 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Knop1Q9Z2Q2 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Knop1Q9Z2Q2 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Knop1Q9Z2Q2 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Knop1Q9Z2Q2 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms