Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D7

Mbd4, Methyl-CpG-binding domain protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd4Q9Z2D7 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mbd4Q9Z2D7 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mbd4Q9Z2D7 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mbd4Q9Z2D7 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mbd4Q9Z2D7 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mbd4Q9Z2D7 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mbd4Q9Z2D7 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mbd4Q9Z2D7 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mbd4Q9Z2D7 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mbd4Q9Z2D7 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mbd4Q9Z2D7 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mbd4Q9Z2D7 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mbd4Q9Z2D7 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Mbd4Q9Z2D7 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Mbd4Q9Z2D7 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mbd4Q9Z2D7 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mbd4Q9Z2D7 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mbd4Q9Z2D7 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mbd4Q9Z2D7 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mbd4Q9Z2D7 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mbd4Q9Z2D7 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mbd4Q9Z2D7 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mbd4Q9Z2D7 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mbd4Q9Z2D7 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mbd4Q9Z2D7 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Mbd4Q9Z2D7 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mbd4Q9Z2D7 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mbd4Q9Z2D7 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mbd4Q9Z2D7 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mbd4Q9Z2D7 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mbd4Q9Z2D7 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mbd4Q9Z2D7 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mbd4Q9Z2D7 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mbd4Q9Z2D7 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mbd4Q9Z2D7 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mbd4Q9Z2D7 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mbd4Q9Z2D7 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mbd4Q9Z2D7 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mbd4Q9Z2D7 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mbd4Q9Z2D7 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mbd4Q9Z2D7 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mbd4Q9Z2D7 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mbd4Q9Z2D7 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mbd4Q9Z2D7 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mbd4Q9Z2D7 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Mbd4Q9Z2D7 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Mbd4Q9Z2D7 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Mbd4Q9Z2D7 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Mbd4Q9Z2D7 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mbd4Q9Z2D7 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Mbd4Q9Z2D7 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Mbd4Q9Z2D7 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mbd4Q9Z2D7 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Mbd4Q9Z2D7 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mbd4Q9Z2D7 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mbd4Q9Z2D7 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Mbd4Q9Z2D7 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mbd4Q9Z2D7 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mbd4Q9Z2D7 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mbd4Q9Z2D7 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Mbd4Q9Z2D7 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mbd4Q9Z2D7 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mbd4Q9Z2D7 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mbd4Q9Z2D7 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mbd4Q9Z2D7 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mbd4Q9Z2D7 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mbd4Q9Z2D7 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mbd4Q9Z2D7 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mbd4Q9Z2D7 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mbd4Q9Z2D7 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mbd4Q9Z2D7 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mbd4Q9Z2D7 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Mbd4Q9Z2D7 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mbd4Q9Z2D7 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mbd4Q9Z2D7 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Mbd4Q9Z2D7 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mbd4Q9Z2D7 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mbd4Q9Z2D7 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Mbd4Q9Z2D7 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Mbd4Q9Z2D7 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mbd4Q9Z2D7 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mbd4Q9Z2D7 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mbd4Q9Z2D7 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mbd4Q9Z2D7 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Mbd4Q9Z2D7 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mbd4Q9Z2D7 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mbd4Q9Z2D7 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mbd4Q9Z2D7 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mbd4Q9Z2D7 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mbd4Q9Z2D7 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mbd4Q9Z2D7 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mbd4Q9Z2D7 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mbd4Q9Z2D7 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Mbd4Q9Z2D7 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mbd4Q9Z2D7 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mbd4Q9Z2D7 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mbd4Q9Z2D7 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mbd4Q9Z2D7 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mbd4Q9Z2D7 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mbd4Q9Z2D7 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms