Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2C6

Upk1b, Uroplakin-1b, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk1bQ9Z2C6 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Upk1bQ9Z2C6 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Upk1bQ9Z2C6 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Upk1bQ9Z2C6 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Upk1bQ9Z2C6 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Upk1bQ9Z2C6 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Upk1bQ9Z2C6 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Upk1bQ9Z2C6 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Upk1bQ9Z2C6 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Upk1bQ9Z2C6 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Upk1bQ9Z2C6 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Upk1bQ9Z2C6 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Upk1bQ9Z2C6 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Upk1bQ9Z2C6 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Upk1bQ9Z2C6 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Upk1bQ9Z2C6 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Upk1bQ9Z2C6 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Upk1bQ9Z2C6 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Upk1bQ9Z2C6 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Upk1bQ9Z2C6 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Upk1bQ9Z2C6 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Upk1bQ9Z2C6 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Upk1bQ9Z2C6 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Upk1bQ9Z2C6 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Upk1bQ9Z2C6 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Upk1bQ9Z2C6 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Upk1bQ9Z2C6 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Upk1bQ9Z2C6 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Upk1bQ9Z2C6 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Upk1bQ9Z2C6 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Upk1bQ9Z2C6 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Upk1bQ9Z2C6 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Upk1bQ9Z2C6 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Upk1bQ9Z2C6 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Upk1bQ9Z2C6 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Upk1bQ9Z2C6 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Upk1bQ9Z2C6 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Upk1bQ9Z2C6 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Upk1bQ9Z2C6 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Upk1bQ9Z2C6 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Upk1bQ9Z2C6 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Upk1bQ9Z2C6 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Upk1bQ9Z2C6 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Upk1bQ9Z2C6 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Upk1bQ9Z2C6 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Upk1bQ9Z2C6 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Upk1bQ9Z2C6 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Upk1bQ9Z2C6 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Upk1bQ9Z2C6 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Upk1bQ9Z2C6 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
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Upk1bQ9Z2C6 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Upk1bQ9Z2C6 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Upk1bQ9Z2C6 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Upk1bQ9Z2C6 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Upk1bQ9Z2C6 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Upk1bQ9Z2C6 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Upk1bQ9Z2C6 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Upk1bQ9Z2C6 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Upk1bQ9Z2C6 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Upk1bQ9Z2C6 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Upk1bQ9Z2C6 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Upk1bQ9Z2C6 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Upk1bQ9Z2C6 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Upk1bQ9Z2C6 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Upk1bQ9Z2C6 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Upk1bQ9Z2C6 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
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Upk1bQ9Z2C6 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Upk1bQ9Z2C6 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Upk1bQ9Z2C6 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Upk1bQ9Z2C6 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Upk1bQ9Z2C6 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Upk1bQ9Z2C6 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Upk1bQ9Z2C6 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Upk1bQ9Z2C6 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Upk1bQ9Z2C6 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Upk1bQ9Z2C6 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Upk1bQ9Z2C6 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Upk1bQ9Z2C6 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Upk1bQ9Z2C6 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Upk1bQ9Z2C6 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Upk1bQ9Z2C6 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Upk1bQ9Z2C6 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Upk1bQ9Z2C6 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Upk1bQ9Z2C6 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Upk1bQ9Z2C6 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Upk1bQ9Z2C6 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Upk1bQ9Z2C6 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Upk1bQ9Z2C6 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Upk1bQ9Z2C6 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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