Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2A0

Pdpk1, 3-phosphoinositide-dependent protein kinase 1, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdpk1Q9Z2A0 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
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Pdpk1Q9Z2A0 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdpk1Q9Z2A0 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdpk1Q9Z2A0 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Pdpk1Q9Z2A0 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Pdpk1Q9Z2A0 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdpk1Q9Z2A0 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdpk1Q9Z2A0 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdpk1Q9Z2A0 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdpk1Q9Z2A0 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Pdpk1Q9Z2A0 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdpk1Q9Z2A0 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdpk1Q9Z2A0 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdpk1Q9Z2A0 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdpk1Q9Z2A0 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdpk1Q9Z2A0 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdpk1Q9Z2A0 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdpk1Q9Z2A0 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdpk1Q9Z2A0 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdpk1Q9Z2A0 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdpk1Q9Z2A0 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdpk1Q9Z2A0 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Pdpk1Q9Z2A0 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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