Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z261

Cldn7, Claudin-7, mousemouse

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Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn7Q9Z261 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Cldn7Q9Z261 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn7Q9Z261 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn7Q9Z261 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn7Q9Z261 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Cldn7Q9Z261 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn7Q9Z261 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn7Q9Z261 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn7Q9Z261 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn7Q9Z261 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn7Q9Z261 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn7Q9Z261 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn7Q9Z261 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn7Q9Z261 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn7Q9Z261 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Cldn7Q9Z261 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn7Q9Z261 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn7Q9Z261 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn7Q9Z261 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Cldn7Q9Z261 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn7Q9Z261 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn7Q9Z261 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn7Q9Z261 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Cldn7Q9Z261 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Cldn7Q9Z261 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn7Q9Z261 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn7Q9Z261 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn7Q9Z261 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn7Q9Z261 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Cldn7Q9Z261 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn7Q9Z261 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn7Q9Z261 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Cldn7Q9Z261 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Cldn7Q9Z261 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Cldn7Q9Z261 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Cldn7Q9Z261 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn7Q9Z261 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn7Q9Z261 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Cldn7Q9Z261 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Cldn7Q9Z261 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cldn7Q9Z261 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Cldn7Q9Z261 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cldn7Q9Z261 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn7Q9Z261 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn7Q9Z261 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn7Q9Z261 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn7Q9Z261 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn7Q9Z261 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn7Q9Z261 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn7Q9Z261 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn7Q9Z261 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn7Q9Z261 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn7Q9Z261 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn7Q9Z261 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn7Q9Z261 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn7Q9Z261 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn7Q9Z261 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn7Q9Z261 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn7Q9Z261 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn7Q9Z261 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn7Q9Z261 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn7Q9Z261 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn7Q9Z261 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn7Q9Z261 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn7Q9Z261 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn7Q9Z261 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn7Q9Z261 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn7Q9Z261 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms