Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z238

Ccne2, G1/S-specific cyclin-E2, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccne2Q9Z238 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccne2Q9Z238 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccne2Q9Z238 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccne2Q9Z238 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccne2Q9Z238 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccne2Q9Z238 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccne2Q9Z238 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccne2Q9Z238 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccne2Q9Z238 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccne2Q9Z238 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccne2Q9Z238 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccne2Q9Z238 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccne2Q9Z238 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccne2Q9Z238 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccne2Q9Z238 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccne2Q9Z238 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccne2Q9Z238 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccne2Q9Z238 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccne2Q9Z238 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccne2Q9Z238 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccne2Q9Z238 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccne2Q9Z238 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccne2Q9Z238 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccne2Q9Z238 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccne2Q9Z238 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccne2Q9Z238 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccne2Q9Z238 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccne2Q9Z238 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccne2Q9Z238 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccne2Q9Z238 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccne2Q9Z238 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccne2Q9Z238 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccne2Q9Z238 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccne2Q9Z238 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccne2Q9Z238 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccne2Q9Z238 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccne2Q9Z238 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccne2Q9Z238 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccne2Q9Z238 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccne2Q9Z238 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccne2Q9Z238 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccne2Q9Z238 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccne2Q9Z238 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccne2Q9Z238 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccne2Q9Z238 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccne2Q9Z238 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccne2Q9Z238 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccne2Q9Z238 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccne2Q9Z238 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccne2Q9Z238 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccne2Q9Z238 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccne2Q9Z238 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccne2Q9Z238 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccne2Q9Z238 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccne2Q9Z238 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccne2Q9Z238 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccne2Q9Z238 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccne2Q9Z238 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccne2Q9Z238 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccne2Q9Z238 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccne2Q9Z238 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccne2Q9Z238 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccne2Q9Z238 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccne2Q9Z238 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccne2Q9Z238 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccne2Q9Z238 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccne2Q9Z238 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccne2Q9Z238 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccne2Q9Z238 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccne2Q9Z238 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccne2Q9Z238 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccne2Q9Z238 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccne2Q9Z238 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccne2Q9Z238 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccne2Q9Z238 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccne2Q9Z238 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccne2Q9Z238 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccne2Q9Z238 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccne2Q9Z238 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccne2Q9Z238 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccne2Q9Z238 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccne2Q9Z238 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccne2Q9Z238 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccne2Q9Z238 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccne2Q9Z238 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccne2Q9Z238 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccne2Q9Z238 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccne2Q9Z238 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccne2Q9Z238 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccne2Q9Z238 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccne2Q9Z238 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccne2Q9Z238 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccne2Q9Z238 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccne2Q9Z238 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccne2Q9Z238 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccne2Q9Z238 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccne2Q9Z238 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccne2Q9Z238 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccne2Q9Z238 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccne2Q9Z238 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms