Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Y4

Trip6, Thyroid receptor-interacting protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip6Q9Z1Y4 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trip6Q9Z1Y4 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Trip6Q9Z1Y4 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trip6Q9Z1Y4 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trip6Q9Z1Y4 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trip6Q9Z1Y4 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trip6Q9Z1Y4 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trip6Q9Z1Y4 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trip6Q9Z1Y4 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trip6Q9Z1Y4 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trip6Q9Z1Y4 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trip6Q9Z1Y4 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trip6Q9Z1Y4 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trip6Q9Z1Y4 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trip6Q9Z1Y4 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trip6Q9Z1Y4 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trip6Q9Z1Y4 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trip6Q9Z1Y4 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trip6Q9Z1Y4 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trip6Q9Z1Y4 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Trip6Q9Z1Y4 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trip6Q9Z1Y4 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trip6Q9Z1Y4 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trip6Q9Z1Y4 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trip6Q9Z1Y4 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trip6Q9Z1Y4 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trip6Q9Z1Y4 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trip6Q9Z1Y4 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trip6Q9Z1Y4 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trip6Q9Z1Y4 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trip6Q9Z1Y4 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trip6Q9Z1Y4 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trip6Q9Z1Y4 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trip6Q9Z1Y4 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trip6Q9Z1Y4 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Trip6Q9Z1Y4 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trip6Q9Z1Y4 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trip6Q9Z1Y4 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trip6Q9Z1Y4 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trip6Q9Z1Y4 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Trip6Q9Z1Y4 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trip6Q9Z1Y4 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trip6Q9Z1Y4 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trip6Q9Z1Y4 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trip6Q9Z1Y4 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trip6Q9Z1Y4 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trip6Q9Z1Y4 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trip6Q9Z1Y4 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trip6Q9Z1Y4 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trip6Q9Z1Y4 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trip6Q9Z1Y4 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trip6Q9Z1Y4 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trip6Q9Z1Y4 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trip6Q9Z1Y4 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trip6Q9Z1Y4 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trip6Q9Z1Y4 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trip6Q9Z1Y4 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trip6Q9Z1Y4 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trip6Q9Z1Y4 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trip6Q9Z1Y4 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Trip6Q9Z1Y4 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trip6Q9Z1Y4 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trip6Q9Z1Y4 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trip6Q9Z1Y4 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trip6Q9Z1Y4 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trip6Q9Z1Y4 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Trip6Q9Z1Y4 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Trip6Q9Z1Y4 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Trip6Q9Z1Y4 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Trip6Q9Z1Y4 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trip6Q9Z1Y4 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trip6Q9Z1Y4 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trip6Q9Z1Y4 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trip6Q9Z1Y4 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trip6Q9Z1Y4 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trip6Q9Z1Y4 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trip6Q9Z1Y4 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trip6Q9Z1Y4 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trip6Q9Z1Y4 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trip6Q9Z1Y4 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trip6Q9Z1Y4 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trip6Q9Z1Y4 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trip6Q9Z1Y4 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trip6Q9Z1Y4 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trip6Q9Z1Y4 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trip6Q9Z1Y4 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trip6Q9Z1Y4 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trip6Q9Z1Y4 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trip6Q9Z1Y4 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Trip6Q9Z1Y4 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trip6Q9Z1Y4 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trip6Q9Z1Y4 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Trip6Q9Z1Y4 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trip6Q9Z1Y4 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trip6Q9Z1Y4 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trip6Q9Z1Y4 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trip6Q9Z1Y4 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trip6Q9Z1Y4 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Trip6Q9Z1Y4 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Trip6Q9Z1Y4 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms