Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T1

Ap3b1, AP-3 complex subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b1Q9Z1T1 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ap3b1Q9Z1T1 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ap3b1Q9Z1T1 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ap3b1Q9Z1T1 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ap3b1Q9Z1T1 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ap3b1Q9Z1T1 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ap3b1Q9Z1T1 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Ap3b1Q9Z1T1 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ap3b1Q9Z1T1 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Ap3b1Q9Z1T1 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ap3b1Q9Z1T1 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ap3b1Q9Z1T1 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ap3b1Q9Z1T1 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ap3b1Q9Z1T1 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ap3b1Q9Z1T1 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ap3b1Q9Z1T1 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ap3b1Q9Z1T1 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ap3b1Q9Z1T1 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Ap3b1Q9Z1T1 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ap3b1Q9Z1T1 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ap3b1Q9Z1T1 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ap3b1Q9Z1T1 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Ap3b1Q9Z1T1 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ap3b1Q9Z1T1 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ap3b1Q9Z1T1 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ap3b1Q9Z1T1 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ap3b1Q9Z1T1 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Ap3b1Q9Z1T1 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ap3b1Q9Z1T1 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ap3b1Q9Z1T1 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ap3b1Q9Z1T1 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ap3b1Q9Z1T1 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ap3b1Q9Z1T1 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ap3b1Q9Z1T1 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ap3b1Q9Z1T1 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ap3b1Q9Z1T1 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ap3b1Q9Z1T1 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ap3b1Q9Z1T1 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ap3b1Q9Z1T1 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ap3b1Q9Z1T1 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ap3b1Q9Z1T1 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Ap3b1Q9Z1T1 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ap3b1Q9Z1T1 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ap3b1Q9Z1T1 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ap3b1Q9Z1T1 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Ap3b1Q9Z1T1 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Ap3b1Q9Z1T1 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ap3b1Q9Z1T1 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ap3b1Q9Z1T1 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ap3b1Q9Z1T1 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ap3b1Q9Z1T1 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ap3b1Q9Z1T1 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ap3b1Q9Z1T1 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ap3b1Q9Z1T1 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ap3b1Q9Z1T1 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ap3b1Q9Z1T1 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ap3b1Q9Z1T1 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ap3b1Q9Z1T1 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ap3b1Q9Z1T1 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ap3b1Q9Z1T1 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ap3b1Q9Z1T1 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ap3b1Q9Z1T1 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Ap3b1Q9Z1T1 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ap3b1Q9Z1T1 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ap3b1Q9Z1T1 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ap3b1Q9Z1T1 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ap3b1Q9Z1T1 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ap3b1Q9Z1T1 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ap3b1Q9Z1T1 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ap3b1Q9Z1T1 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ap3b1Q9Z1T1 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Ap3b1Q9Z1T1 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ap3b1Q9Z1T1 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ap3b1Q9Z1T1 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ap3b1Q9Z1T1 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ap3b1Q9Z1T1 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Ap3b1Q9Z1T1 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ap3b1Q9Z1T1 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ap3b1Q9Z1T1 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ap3b1Q9Z1T1 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ap3b1Q9Z1T1 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ap3b1Q9Z1T1 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Ap3b1Q9Z1T1 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ap3b1Q9Z1T1 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ap3b1Q9Z1T1 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ap3b1Q9Z1T1 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ap3b1Q9Z1T1 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ap3b1Q9Z1T1 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ap3b1Q9Z1T1 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ap3b1Q9Z1T1 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Ap3b1Q9Z1T1 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ap3b1Q9Z1T1 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ap3b1Q9Z1T1 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ap3b1Q9Z1T1 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ap3b1Q9Z1T1 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ap3b1Q9Z1T1 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ap3b1Q9Z1T1 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ap3b1Q9Z1T1 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ap3b1Q9Z1T1 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ap3b1Q9Z1T1 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 146.3 ms