Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1P4

Lgr5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr5Q9Z1P4 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lgr5Q9Z1P4 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lgr5Q9Z1P4 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lgr5Q9Z1P4 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lgr5Q9Z1P4 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lgr5Q9Z1P4 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lgr5Q9Z1P4 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lgr5Q9Z1P4 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lgr5Q9Z1P4 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lgr5Q9Z1P4 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lgr5Q9Z1P4 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lgr5Q9Z1P4 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lgr5Q9Z1P4 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lgr5Q9Z1P4 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lgr5Q9Z1P4 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lgr5Q9Z1P4 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lgr5Q9Z1P4 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lgr5Q9Z1P4 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lgr5Q9Z1P4 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lgr5Q9Z1P4 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lgr5Q9Z1P4 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lgr5Q9Z1P4 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lgr5Q9Z1P4 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lgr5Q9Z1P4 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lgr5Q9Z1P4 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lgr5Q9Z1P4 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lgr5Q9Z1P4 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lgr5Q9Z1P4 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lgr5Q9Z1P4 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lgr5Q9Z1P4 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lgr5Q9Z1P4 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lgr5Q9Z1P4 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lgr5Q9Z1P4 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lgr5Q9Z1P4 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lgr5Q9Z1P4 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lgr5Q9Z1P4 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lgr5Q9Z1P4 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lgr5Q9Z1P4 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lgr5Q9Z1P4 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lgr5Q9Z1P4 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lgr5Q9Z1P4 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lgr5Q9Z1P4 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lgr5Q9Z1P4 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lgr5Q9Z1P4 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lgr5Q9Z1P4 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lgr5Q9Z1P4 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lgr5Q9Z1P4 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lgr5Q9Z1P4 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lgr5Q9Z1P4 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lgr5Q9Z1P4 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lgr5Q9Z1P4 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lgr5Q9Z1P4 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lgr5Q9Z1P4 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lgr5Q9Z1P4 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lgr5Q9Z1P4 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lgr5Q9Z1P4 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lgr5Q9Z1P4 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lgr5Q9Z1P4 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lgr5Q9Z1P4 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lgr5Q9Z1P4 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lgr5Q9Z1P4 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lgr5Q9Z1P4 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Lgr5Q9Z1P4 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lgr5Q9Z1P4 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lgr5Q9Z1P4 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lgr5Q9Z1P4 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lgr5Q9Z1P4 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lgr5Q9Z1P4 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lgr5Q9Z1P4 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lgr5Q9Z1P4 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lgr5Q9Z1P4 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lgr5Q9Z1P4 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lgr5Q9Z1P4 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lgr5Q9Z1P4 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lgr5Q9Z1P4 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lgr5Q9Z1P4 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Lgr5Q9Z1P4 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lgr5Q9Z1P4 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lgr5Q9Z1P4 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lgr5Q9Z1P4 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lgr5Q9Z1P4 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lgr5Q9Z1P4 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Lgr5Q9Z1P4 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lgr5Q9Z1P4 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lgr5Q9Z1P4 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lgr5Q9Z1P4 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lgr5Q9Z1P4 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lgr5Q9Z1P4 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lgr5Q9Z1P4 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lgr5Q9Z1P4 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lgr5Q9Z1P4 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lgr5Q9Z1P4 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lgr5Q9Z1P4 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lgr5Q9Z1P4 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lgr5Q9Z1P4 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lgr5Q9Z1P4 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lgr5Q9Z1P4 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lgr5Q9Z1P4 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lgr5Q9Z1P4 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Lgr5Q9Z1P4 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms