Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S4

Cldn13, Claudin-13, mousemouse

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Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn13Q9Z0S4 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn13Q9Z0S4 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn13Q9Z0S4 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn13Q9Z0S4 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn13Q9Z0S4 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn13Q9Z0S4 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn13Q9Z0S4 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn13Q9Z0S4 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn13Q9Z0S4 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn13Q9Z0S4 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn13Q9Z0S4 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn13Q9Z0S4 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn13Q9Z0S4 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn13Q9Z0S4 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn13Q9Z0S4 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn13Q9Z0S4 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn13Q9Z0S4 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn13Q9Z0S4 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn13Q9Z0S4 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn13Q9Z0S4 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn13Q9Z0S4 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn13Q9Z0S4 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn13Q9Z0S4 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn13Q9Z0S4 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn13Q9Z0S4 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn13Q9Z0S4 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn13Q9Z0S4 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn13Q9Z0S4 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn13Q9Z0S4 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn13Q9Z0S4 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn13Q9Z0S4 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn13Q9Z0S4 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn13Q9Z0S4 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn13Q9Z0S4 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn13Q9Z0S4 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn13Q9Z0S4 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Cldn13Q9Z0S4 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn13Q9Z0S4 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn13Q9Z0S4 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn13Q9Z0S4 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn13Q9Z0S4 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn13Q9Z0S4 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn13Q9Z0S4 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn13Q9Z0S4 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn13Q9Z0S4 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn13Q9Z0S4 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn13Q9Z0S4 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn13Q9Z0S4 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn13Q9Z0S4 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn13Q9Z0S4 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn13Q9Z0S4 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn13Q9Z0S4 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn13Q9Z0S4 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn13Q9Z0S4 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn13Q9Z0S4 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn13Q9Z0S4 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Cldn13Q9Z0S4 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Cldn13Q9Z0S4 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn13Q9Z0S4 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn13Q9Z0S4 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Cldn13Q9Z0S4 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn13Q9Z0S4 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn13Q9Z0S4 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn13Q9Z0S4 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn13Q9Z0S4 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn13Q9Z0S4 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn13Q9Z0S4 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn13Q9Z0S4 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn13Q9Z0S4 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn13Q9Z0S4 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn13Q9Z0S4 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn13Q9Z0S4 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn13Q9Z0S4 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn13Q9Z0S4 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn13Q9Z0S4 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn13Q9Z0S4 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn13Q9Z0S4 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Cldn13Q9Z0S4 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn13Q9Z0S4 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn13Q9Z0S4 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn13Q9Z0S4 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn13Q9Z0S4 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn13Q9Z0S4 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn13Q9Z0S4 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn13Q9Z0S4 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn13Q9Z0S4 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn13Q9Z0S4 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn13Q9Z0S4 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn13Q9Z0S4 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn13Q9Z0S4 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn13Q9Z0S4 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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