Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVP6

Papolb, Poly(A) polymerase beta, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PapolbQ9WVP6 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PapolbQ9WVP6 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PapolbQ9WVP6 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PapolbQ9WVP6 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PapolbQ9WVP6 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PapolbQ9WVP6 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PapolbQ9WVP6 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PapolbQ9WVP6 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PapolbQ9WVP6 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PapolbQ9WVP6 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PapolbQ9WVP6 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PapolbQ9WVP6 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PapolbQ9WVP6 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PapolbQ9WVP6 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PapolbQ9WVP6 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PapolbQ9WVP6 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PapolbQ9WVP6 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PapolbQ9WVP6 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PapolbQ9WVP6 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PapolbQ9WVP6 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PapolbQ9WVP6 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PapolbQ9WVP6 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PapolbQ9WVP6 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PapolbQ9WVP6 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PapolbQ9WVP6 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PapolbQ9WVP6 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PapolbQ9WVP6 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PapolbQ9WVP6 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PapolbQ9WVP6 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PapolbQ9WVP6 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PapolbQ9WVP6 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PapolbQ9WVP6 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PapolbQ9WVP6 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PapolbQ9WVP6 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PapolbQ9WVP6 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.39■□□□□ 0.22
PapolbQ9WVP6 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
PapolbQ9WVP6 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
PapolbQ9WVP6 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
PapolbQ9WVP6 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PapolbQ9WVP6 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PapolbQ9WVP6 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PapolbQ9WVP6 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PapolbQ9WVP6 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PapolbQ9WVP6 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PapolbQ9WVP6 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PapolbQ9WVP6 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PapolbQ9WVP6 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PapolbQ9WVP6 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PapolbQ9WVP6 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PapolbQ9WVP6 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PapolbQ9WVP6 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PapolbQ9WVP6 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PapolbQ9WVP6 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PapolbQ9WVP6 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PapolbQ9WVP6 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PapolbQ9WVP6 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PapolbQ9WVP6 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PapolbQ9WVP6 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PapolbQ9WVP6 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PapolbQ9WVP6 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PapolbQ9WVP6 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PapolbQ9WVP6 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PapolbQ9WVP6 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PapolbQ9WVP6 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PapolbQ9WVP6 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PapolbQ9WVP6 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PapolbQ9WVP6 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PapolbQ9WVP6 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PapolbQ9WVP6 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PapolbQ9WVP6 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PapolbQ9WVP6 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PapolbQ9WVP6 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PapolbQ9WVP6 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PapolbQ9WVP6 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PapolbQ9WVP6 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PapolbQ9WVP6 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PapolbQ9WVP6 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PapolbQ9WVP6 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PapolbQ9WVP6 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PapolbQ9WVP6 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PapolbQ9WVP6 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PapolbQ9WVP6 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PapolbQ9WVP6 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PapolbQ9WVP6 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PapolbQ9WVP6 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PapolbQ9WVP6 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PapolbQ9WVP6 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PapolbQ9WVP6 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PapolbQ9WVP6 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PapolbQ9WVP6 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PapolbQ9WVP6 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PapolbQ9WVP6 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PapolbQ9WVP6 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PapolbQ9WVP6 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PapolbQ9WVP6 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PapolbQ9WVP6 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PapolbQ9WVP6 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PapolbQ9WVP6 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PapolbQ9WVP6 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PapolbQ9WVP6 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms