Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV85

Nme3, Nucleoside diphosphate kinase 3, mousemouse

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme3Q9WV85 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nme3Q9WV85 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nme3Q9WV85 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nme3Q9WV85 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nme3Q9WV85 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Nme3Q9WV85 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nme3Q9WV85 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Nme3Q9WV85 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nme3Q9WV85 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
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Nme3Q9WV85 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nme3Q9WV85 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nme3Q9WV85 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nme3Q9WV85 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nme3Q9WV85 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nme3Q9WV85 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Nme3Q9WV85 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nme3Q9WV85 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nme3Q9WV85 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nme3Q9WV85 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nme3Q9WV85 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nme3Q9WV85 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nme3Q9WV85 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nme3Q9WV85 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nme3Q9WV85 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nme3Q9WV85 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nme3Q9WV85 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nme3Q9WV85 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nme3Q9WV85 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nme3Q9WV85 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nme3Q9WV85 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nme3Q9WV85 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nme3Q9WV85 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nme3Q9WV85 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nme3Q9WV85 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nme3Q9WV85 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nme3Q9WV85 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nme3Q9WV85 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Nme3Q9WV85 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nme3Q9WV85 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nme3Q9WV85 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Nme3Q9WV85 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nme3Q9WV85 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nme3Q9WV85 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Nme3Q9WV85 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nme3Q9WV85 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Nme3Q9WV85 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nme3Q9WV85 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nme3Q9WV85 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
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Nme3Q9WV85 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nme3Q9WV85 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nme3Q9WV85 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nme3Q9WV85 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nme3Q9WV85 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nme3Q9WV85 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nme3Q9WV85 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nme3Q9WV85 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nme3Q9WV85 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nme3Q9WV85 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nme3Q9WV85 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nme3Q9WV85 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nme3Q9WV85 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nme3Q9WV85 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nme3Q9WV85 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Nme3Q9WV85 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nme3Q9WV85 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nme3Q9WV85 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nme3Q9WV85 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nme3Q9WV85 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms