Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU22

Ptpn4, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 4, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn4Q9WU22 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptpn4Q9WU22 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptpn4Q9WU22 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptpn4Q9WU22 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptpn4Q9WU22 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptpn4Q9WU22 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptpn4Q9WU22 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptpn4Q9WU22 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptpn4Q9WU22 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptpn4Q9WU22 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptpn4Q9WU22 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptpn4Q9WU22 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptpn4Q9WU22 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptpn4Q9WU22 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptpn4Q9WU22 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptpn4Q9WU22 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptpn4Q9WU22 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptpn4Q9WU22 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptpn4Q9WU22 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptpn4Q9WU22 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptpn4Q9WU22 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptpn4Q9WU22 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptpn4Q9WU22 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptpn4Q9WU22 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptpn4Q9WU22 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptpn4Q9WU22 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptpn4Q9WU22 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptpn4Q9WU22 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptpn4Q9WU22 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptpn4Q9WU22 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptpn4Q9WU22 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptpn4Q9WU22 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptpn4Q9WU22 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptpn4Q9WU22 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptpn4Q9WU22 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptpn4Q9WU22 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptpn4Q9WU22 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptpn4Q9WU22 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptpn4Q9WU22 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptpn4Q9WU22 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptpn4Q9WU22 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptpn4Q9WU22 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptpn4Q9WU22 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptpn4Q9WU22 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptpn4Q9WU22 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptpn4Q9WU22 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptpn4Q9WU22 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptpn4Q9WU22 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptpn4Q9WU22 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptpn4Q9WU22 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptpn4Q9WU22 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptpn4Q9WU22 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptpn4Q9WU22 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptpn4Q9WU22 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptpn4Q9WU22 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptpn4Q9WU22 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptpn4Q9WU22 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptpn4Q9WU22 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptpn4Q9WU22 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptpn4Q9WU22 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptpn4Q9WU22 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptpn4Q9WU22 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptpn4Q9WU22 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptpn4Q9WU22 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptpn4Q9WU22 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptpn4Q9WU22 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptpn4Q9WU22 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptpn4Q9WU22 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptpn4Q9WU22 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptpn4Q9WU22 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptpn4Q9WU22 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptpn4Q9WU22 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptpn4Q9WU22 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptpn4Q9WU22 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptpn4Q9WU22 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptpn4Q9WU22 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptpn4Q9WU22 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptpn4Q9WU22 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptpn4Q9WU22 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptpn4Q9WU22 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptpn4Q9WU22 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptpn4Q9WU22 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptpn4Q9WU22 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptpn4Q9WU22 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptpn4Q9WU22 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptpn4Q9WU22 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptpn4Q9WU22 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptpn4Q9WU22 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptpn4Q9WU22 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptpn4Q9WU22 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptpn4Q9WU22 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptpn4Q9WU22 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptpn4Q9WU22 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptpn4Q9WU22 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptpn4Q9WU22 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptpn4Q9WU22 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptpn4Q9WU22 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptpn4Q9WU22 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptpn4Q9WU22 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptpn4Q9WU22 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms