Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTU3

Scn8a, Sodium channel protein type 8 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,978 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn8aQ9WTU3 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn8aQ9WTU3 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn8aQ9WTU3 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn8aQ9WTU3 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn8aQ9WTU3 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn8aQ9WTU3 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn8aQ9WTU3 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn8aQ9WTU3 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn8aQ9WTU3 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn8aQ9WTU3 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn8aQ9WTU3 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn8aQ9WTU3 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn8aQ9WTU3 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn8aQ9WTU3 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn8aQ9WTU3 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn8aQ9WTU3 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn8aQ9WTU3 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn8aQ9WTU3 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn8aQ9WTU3 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn8aQ9WTU3 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn8aQ9WTU3 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn8aQ9WTU3 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn8aQ9WTU3 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn8aQ9WTU3 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn8aQ9WTU3 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn8aQ9WTU3 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn8aQ9WTU3 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn8aQ9WTU3 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn8aQ9WTU3 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn8aQ9WTU3 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn8aQ9WTU3 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn8aQ9WTU3 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn8aQ9WTU3 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn8aQ9WTU3 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn8aQ9WTU3 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn8aQ9WTU3 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn8aQ9WTU3 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn8aQ9WTU3 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn8aQ9WTU3 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn8aQ9WTU3 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn8aQ9WTU3 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn8aQ9WTU3 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn8aQ9WTU3 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn8aQ9WTU3 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn8aQ9WTU3 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn8aQ9WTU3 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Scn8aQ9WTU3 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Scn8aQ9WTU3 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Scn8aQ9WTU3 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Scn8aQ9WTU3 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Scn8aQ9WTU3 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Scn8aQ9WTU3 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Scn8aQ9WTU3 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Scn8aQ9WTU3 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scn8aQ9WTU3 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scn8aQ9WTU3 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scn8aQ9WTU3 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scn8aQ9WTU3 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scn8aQ9WTU3 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scn8aQ9WTU3 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scn8aQ9WTU3 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scn8aQ9WTU3 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Scn8aQ9WTU3 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scn8aQ9WTU3 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scn8aQ9WTU3 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scn8aQ9WTU3 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scn8aQ9WTU3 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scn8aQ9WTU3 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scn8aQ9WTU3 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scn8aQ9WTU3 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scn8aQ9WTU3 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scn8aQ9WTU3 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scn8aQ9WTU3 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Scn8aQ9WTU3 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scn8aQ9WTU3 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scn8aQ9WTU3 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Scn8aQ9WTU3 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scn8aQ9WTU3 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scn8aQ9WTU3 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scn8aQ9WTU3 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scn8aQ9WTU3 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scn8aQ9WTU3 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scn8aQ9WTU3 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scn8aQ9WTU3 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scn8aQ9WTU3 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scn8aQ9WTU3 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scn8aQ9WTU3 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scn8aQ9WTU3 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scn8aQ9WTU3 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scn8aQ9WTU3 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scn8aQ9WTU3 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scn8aQ9WTU3 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scn8aQ9WTU3 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scn8aQ9WTU3 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scn8aQ9WTU3 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scn8aQ9WTU3 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scn8aQ9WTU3 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scn8aQ9WTU3 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scn8aQ9WTU3 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scn8aQ9WTU3 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms