Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1Z8

Sorbs3, Vinexin, mousemouse

Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sorbs3Q9R1Z8 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sorbs3Q9R1Z8 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sorbs3Q9R1Z8 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sorbs3Q9R1Z8 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sorbs3Q9R1Z8 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sorbs3Q9R1Z8 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sorbs3Q9R1Z8 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sorbs3Q9R1Z8 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sorbs3Q9R1Z8 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sorbs3Q9R1Z8 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sorbs3Q9R1Z8 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sorbs3Q9R1Z8 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sorbs3Q9R1Z8 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sorbs3Q9R1Z8 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sorbs3Q9R1Z8 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sorbs3Q9R1Z8 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sorbs3Q9R1Z8 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sorbs3Q9R1Z8 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sorbs3Q9R1Z8 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sorbs3Q9R1Z8 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sorbs3Q9R1Z8 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sorbs3Q9R1Z8 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sorbs3Q9R1Z8 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sorbs3Q9R1Z8 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sorbs3Q9R1Z8 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sorbs3Q9R1Z8 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sorbs3Q9R1Z8 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Sorbs3Q9R1Z8 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sorbs3Q9R1Z8 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sorbs3Q9R1Z8 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sorbs3Q9R1Z8 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sorbs3Q9R1Z8 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sorbs3Q9R1Z8 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sorbs3Q9R1Z8 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sorbs3Q9R1Z8 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sorbs3Q9R1Z8 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sorbs3Q9R1Z8 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sorbs3Q9R1Z8 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sorbs3Q9R1Z8 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sorbs3Q9R1Z8 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sorbs3Q9R1Z8 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sorbs3Q9R1Z8 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sorbs3Q9R1Z8 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Sorbs3Q9R1Z8 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sorbs3Q9R1Z8 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sorbs3Q9R1Z8 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sorbs3Q9R1Z8 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sorbs3Q9R1Z8 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sorbs3Q9R1Z8 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sorbs3Q9R1Z8 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sorbs3Q9R1Z8 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sorbs3Q9R1Z8 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sorbs3Q9R1Z8 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Sorbs3Q9R1Z8 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sorbs3Q9R1Z8 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sorbs3Q9R1Z8 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sorbs3Q9R1Z8 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sorbs3Q9R1Z8 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sorbs3Q9R1Z8 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sorbs3Q9R1Z8 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sorbs3Q9R1Z8 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sorbs3Q9R1Z8 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sorbs3Q9R1Z8 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sorbs3Q9R1Z8 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sorbs3Q9R1Z8 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sorbs3Q9R1Z8 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sorbs3Q9R1Z8 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sorbs3Q9R1Z8 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sorbs3Q9R1Z8 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sorbs3Q9R1Z8 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sorbs3Q9R1Z8 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sorbs3Q9R1Z8 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sorbs3Q9R1Z8 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sorbs3Q9R1Z8 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sorbs3Q9R1Z8 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sorbs3Q9R1Z8 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sorbs3Q9R1Z8 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sorbs3Q9R1Z8 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sorbs3Q9R1Z8 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sorbs3Q9R1Z8 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Sorbs3Q9R1Z8 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Sorbs3Q9R1Z8 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sorbs3Q9R1Z8 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sorbs3Q9R1Z8 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sorbs3Q9R1Z8 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sorbs3Q9R1Z8 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sorbs3Q9R1Z8 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sorbs3Q9R1Z8 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sorbs3Q9R1Z8 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sorbs3Q9R1Z8 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sorbs3Q9R1Z8 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sorbs3Q9R1Z8 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sorbs3Q9R1Z8 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sorbs3Q9R1Z8 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sorbs3Q9R1Z8 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sorbs3Q9R1Z8 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Sorbs3Q9R1Z8 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sorbs3Q9R1Z8 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sorbs3Q9R1Z8 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sorbs3Q9R1Z8 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms