Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0H5

Krt71, Keratin, type II cytoskeletal 71, mousemouse

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt71Q9R0H5 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt71Q9R0H5 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt71Q9R0H5 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt71Q9R0H5 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt71Q9R0H5 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt71Q9R0H5 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt71Q9R0H5 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt71Q9R0H5 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt71Q9R0H5 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt71Q9R0H5 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt71Q9R0H5 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt71Q9R0H5 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt71Q9R0H5 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt71Q9R0H5 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt71Q9R0H5 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt71Q9R0H5 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt71Q9R0H5 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt71Q9R0H5 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt71Q9R0H5 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt71Q9R0H5 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt71Q9R0H5 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt71Q9R0H5 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt71Q9R0H5 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt71Q9R0H5 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt71Q9R0H5 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt71Q9R0H5 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt71Q9R0H5 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt71Q9R0H5 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt71Q9R0H5 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt71Q9R0H5 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt71Q9R0H5 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt71Q9R0H5 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt71Q9R0H5 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt71Q9R0H5 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt71Q9R0H5 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt71Q9R0H5 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt71Q9R0H5 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt71Q9R0H5 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt71Q9R0H5 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt71Q9R0H5 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt71Q9R0H5 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt71Q9R0H5 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt71Q9R0H5 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt71Q9R0H5 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt71Q9R0H5 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt71Q9R0H5 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt71Q9R0H5 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt71Q9R0H5 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt71Q9R0H5 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt71Q9R0H5 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt71Q9R0H5 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt71Q9R0H5 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt71Q9R0H5 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt71Q9R0H5 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt71Q9R0H5 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt71Q9R0H5 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Krt71Q9R0H5 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Krt71Q9R0H5 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Krt71Q9R0H5 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Krt71Q9R0H5 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Krt71Q9R0H5 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Krt71Q9R0H5 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Krt71Q9R0H5 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Krt71Q9R0H5 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Krt71Q9R0H5 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Krt71Q9R0H5 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Krt71Q9R0H5 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt71Q9R0H5 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt71Q9R0H5 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt71Q9R0H5 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt71Q9R0H5 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt71Q9R0H5 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt71Q9R0H5 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt71Q9R0H5 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt71Q9R0H5 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt71Q9R0H5 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt71Q9R0H5 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt71Q9R0H5 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt71Q9R0H5 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt71Q9R0H5 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt71Q9R0H5 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt71Q9R0H5 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt71Q9R0H5 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt71Q9R0H5 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt71Q9R0H5 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt71Q9R0H5 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt71Q9R0H5 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt71Q9R0H5 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt71Q9R0H5 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt71Q9R0H5 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt71Q9R0H5 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt71Q9R0H5 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt71Q9R0H5 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt71Q9R0H5 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt71Q9R0H5 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt71Q9R0H5 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Krt71Q9R0H5 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt71Q9R0H5 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt71Q9R0H5 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Krt71Q9R0H5 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms