Protein–RNA interactions for Protein: Q9R059

Fhl3, Four and a half LIM domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fhl3Q9R059 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Fhl3Q9R059 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
Fhl3Q9R059 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Fhl3Q9R059 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Fhl3Q9R059 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Fhl3Q9R059 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Fhl3Q9R059 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Fhl3Q9R059 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Fhl3Q9R059 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Fhl3Q9R059 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Fhl3Q9R059 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Fhl3Q9R059 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Fhl3Q9R059 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Fhl3Q9R059 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Fhl3Q9R059 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Fhl3Q9R059 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Fhl3Q9R059 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Fhl3Q9R059 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Fhl3Q9R059 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Fhl3Q9R059 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Fhl3Q9R059 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Fhl3Q9R059 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Fhl3Q9R059 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Fhl3Q9R059 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Fhl3Q9R059 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Fhl3Q9R059 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Fhl3Q9R059 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Fhl3Q9R059 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Fhl3Q9R059 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Fhl3Q9R059 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fhl3Q9R059 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fhl3Q9R059 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fhl3Q9R059 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fhl3Q9R059 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Fhl3Q9R059 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fhl3Q9R059 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fhl3Q9R059 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fhl3Q9R059 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fhl3Q9R059 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fhl3Q9R059 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fhl3Q9R059 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fhl3Q9R059 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fhl3Q9R059 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fhl3Q9R059 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fhl3Q9R059 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fhl3Q9R059 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fhl3Q9R059 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fhl3Q9R059 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Fhl3Q9R059 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fhl3Q9R059 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Fhl3Q9R059 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fhl3Q9R059 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fhl3Q9R059 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fhl3Q9R059 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fhl3Q9R059 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fhl3Q9R059 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fhl3Q9R059 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fhl3Q9R059 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fhl3Q9R059 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fhl3Q9R059 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fhl3Q9R059 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fhl3Q9R059 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fhl3Q9R059 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fhl3Q9R059 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fhl3Q9R059 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fhl3Q9R059 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fhl3Q9R059 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fhl3Q9R059 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fhl3Q9R059 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fhl3Q9R059 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fhl3Q9R059 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fhl3Q9R059 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fhl3Q9R059 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Fhl3Q9R059 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Fhl3Q9R059 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fhl3Q9R059 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Fhl3Q9R059 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fhl3Q9R059 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Fhl3Q9R059 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fhl3Q9R059 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Fhl3Q9R059 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fhl3Q9R059 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fhl3Q9R059 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fhl3Q9R059 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fhl3Q9R059 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fhl3Q9R059 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fhl3Q9R059 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fhl3Q9R059 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fhl3Q9R059 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fhl3Q9R059 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fhl3Q9R059 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fhl3Q9R059 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fhl3Q9R059 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fhl3Q9R059 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fhl3Q9R059 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fhl3Q9R059 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fhl3Q9R059 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fhl3Q9R059 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fhl3Q9R059 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fhl3Q9R059 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms