Protein–RNA interactions for Protein: Q9R049

Amfr, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmfrQ9R049 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
AmfrQ9R049 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
AmfrQ9R049 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
AmfrQ9R049 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
AmfrQ9R049 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
AmfrQ9R049 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
AmfrQ9R049 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
AmfrQ9R049 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
AmfrQ9R049 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
AmfrQ9R049 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
AmfrQ9R049 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
AmfrQ9R049 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
AmfrQ9R049 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
AmfrQ9R049 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
AmfrQ9R049 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
AmfrQ9R049 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
AmfrQ9R049 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
AmfrQ9R049 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
AmfrQ9R049 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
AmfrQ9R049 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
AmfrQ9R049 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
AmfrQ9R049 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
AmfrQ9R049 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
AmfrQ9R049 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
AmfrQ9R049 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
AmfrQ9R049 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
AmfrQ9R049 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
AmfrQ9R049 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
AmfrQ9R049 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
AmfrQ9R049 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
AmfrQ9R049 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
AmfrQ9R049 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
AmfrQ9R049 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
AmfrQ9R049 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
AmfrQ9R049 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
AmfrQ9R049 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
AmfrQ9R049 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
AmfrQ9R049 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
AmfrQ9R049 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
AmfrQ9R049 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
AmfrQ9R049 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
AmfrQ9R049 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
AmfrQ9R049 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
AmfrQ9R049 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
AmfrQ9R049 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
AmfrQ9R049 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
AmfrQ9R049 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
AmfrQ9R049 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
AmfrQ9R049 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
AmfrQ9R049 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
AmfrQ9R049 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
AmfrQ9R049 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
AmfrQ9R049 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
AmfrQ9R049 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
AmfrQ9R049 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
AmfrQ9R049 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
AmfrQ9R049 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
AmfrQ9R049 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
AmfrQ9R049 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
AmfrQ9R049 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
AmfrQ9R049 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
AmfrQ9R049 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
AmfrQ9R049 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
AmfrQ9R049 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
AmfrQ9R049 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
AmfrQ9R049 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
AmfrQ9R049 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
AmfrQ9R049 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
AmfrQ9R049 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AmfrQ9R049 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
AmfrQ9R049 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AmfrQ9R049 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
AmfrQ9R049 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
AmfrQ9R049 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
AmfrQ9R049 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AmfrQ9R049 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
AmfrQ9R049 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AmfrQ9R049 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AmfrQ9R049 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
AmfrQ9R049 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AmfrQ9R049 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AmfrQ9R049 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AmfrQ9R049 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
AmfrQ9R049 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AmfrQ9R049 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AmfrQ9R049 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AmfrQ9R049 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
AmfrQ9R049 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AmfrQ9R049 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AmfrQ9R049 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AmfrQ9R049 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AmfrQ9R049 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AmfrQ9R049 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AmfrQ9R049 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
AmfrQ9R049 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AmfrQ9R049 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AmfrQ9R049 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AmfrQ9R049 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AmfrQ9R049 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AmfrQ9R049 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms