Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZW0

Atp11c, Phospholipid-transporting ATPase 11C, mousemouse

Predictions only

Length 1,129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp11cQ9QZW0 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp11cQ9QZW0 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp11cQ9QZW0 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp11cQ9QZW0 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp11cQ9QZW0 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp11cQ9QZW0 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp11cQ9QZW0 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp11cQ9QZW0 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp11cQ9QZW0 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp11cQ9QZW0 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp11cQ9QZW0 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp11cQ9QZW0 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp11cQ9QZW0 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp11cQ9QZW0 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp11cQ9QZW0 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp11cQ9QZW0 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp11cQ9QZW0 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp11cQ9QZW0 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp11cQ9QZW0 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp11cQ9QZW0 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp11cQ9QZW0 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp11cQ9QZW0 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp11cQ9QZW0 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp11cQ9QZW0 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp11cQ9QZW0 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp11cQ9QZW0 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp11cQ9QZW0 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp11cQ9QZW0 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp11cQ9QZW0 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp11cQ9QZW0 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp11cQ9QZW0 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp11cQ9QZW0 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp11cQ9QZW0 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp11cQ9QZW0 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp11cQ9QZW0 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp11cQ9QZW0 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp11cQ9QZW0 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp11cQ9QZW0 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp11cQ9QZW0 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp11cQ9QZW0 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp11cQ9QZW0 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp11cQ9QZW0 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp11cQ9QZW0 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp11cQ9QZW0 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp11cQ9QZW0 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp11cQ9QZW0 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp11cQ9QZW0 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp11cQ9QZW0 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp11cQ9QZW0 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp11cQ9QZW0 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp11cQ9QZW0 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp11cQ9QZW0 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp11cQ9QZW0 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp11cQ9QZW0 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp11cQ9QZW0 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp11cQ9QZW0 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp11cQ9QZW0 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp11cQ9QZW0 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp11cQ9QZW0 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp11cQ9QZW0 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp11cQ9QZW0 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp11cQ9QZW0 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp11cQ9QZW0 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp11cQ9QZW0 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp11cQ9QZW0 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp11cQ9QZW0 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp11cQ9QZW0 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp11cQ9QZW0 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp11cQ9QZW0 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp11cQ9QZW0 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp11cQ9QZW0 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp11cQ9QZW0 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp11cQ9QZW0 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp11cQ9QZW0 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp11cQ9QZW0 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp11cQ9QZW0 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp11cQ9QZW0 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp11cQ9QZW0 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp11cQ9QZW0 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp11cQ9QZW0 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp11cQ9QZW0 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp11cQ9QZW0 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp11cQ9QZW0 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp11cQ9QZW0 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp11cQ9QZW0 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp11cQ9QZW0 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp11cQ9QZW0 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp11cQ9QZW0 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp11cQ9QZW0 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp11cQ9QZW0 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp11cQ9QZW0 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp11cQ9QZW0 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp11cQ9QZW0 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp11cQ9QZW0 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp11cQ9QZW0 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp11cQ9QZW0 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp11cQ9QZW0 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp11cQ9QZW0 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp11cQ9QZW0 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp11cQ9QZW0 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms