Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf4Q9QZS2 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf4Q9QZS2 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf4Q9QZS2 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf4Q9QZS2 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf4Q9QZS2 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf4Q9QZS2 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf4Q9QZS2 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf4Q9QZS2 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf4Q9QZS2 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf4Q9QZS2 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf4Q9QZS2 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf4Q9QZS2 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf4Q9QZS2 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf4Q9QZS2 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf4Q9QZS2 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf4Q9QZS2 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf4Q9QZS2 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf4Q9QZS2 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf4Q9QZS2 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf4Q9QZS2 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf4Q9QZS2 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf4Q9QZS2 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf4Q9QZS2 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf4Q9QZS2 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf4Q9QZS2 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf4Q9QZS2 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf4Q9QZS2 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf4Q9QZS2 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf4Q9QZS2 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf4Q9QZS2 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf4Q9QZS2 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf4Q9QZS2 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf4Q9QZS2 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf4Q9QZS2 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf4Q9QZS2 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf4Q9QZS2 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf4Q9QZS2 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf4Q9QZS2 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf4Q9QZS2 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf4Q9QZS2 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf4Q9QZS2 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf4Q9QZS2 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf4Q9QZS2 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf4Q9QZS2 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf4Q9QZS2 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf4Q9QZS2 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf4Q9QZS2 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf4Q9QZS2 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf4Q9QZS2 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf4Q9QZS2 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf4Q9QZS2 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf4Q9QZS2 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf4Q9QZS2 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf4Q9QZS2 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf4Q9QZS2 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnf4Q9QZS2 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnf4Q9QZS2 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnf4Q9QZS2 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnf4Q9QZS2 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnf4Q9QZS2 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnf4Q9QZS2 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnf4Q9QZS2 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnf4Q9QZS2 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnf4Q9QZS2 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnf4Q9QZS2 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnf4Q9QZS2 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnf4Q9QZS2 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnf4Q9QZS2 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnf4Q9QZS2 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rnf4Q9QZS2 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rnf4Q9QZS2 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rnf4Q9QZS2 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rnf4Q9QZS2 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rnf4Q9QZS2 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rnf4Q9QZS2 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rnf4Q9QZS2 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rnf4Q9QZS2 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf4Q9QZS2 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf4Q9QZS2 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf4Q9QZS2 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf4Q9QZS2 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf4Q9QZS2 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf4Q9QZS2 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf4Q9QZS2 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf4Q9QZS2 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf4Q9QZS2 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf4Q9QZS2 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf4Q9QZS2 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf4Q9QZS2 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf4Q9QZS2 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf4Q9QZS2 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf4Q9QZS2 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf4Q9QZS2 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf4Q9QZS2 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf4Q9QZS2 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf4Q9QZS2 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf4Q9QZS2 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf4Q9QZS2 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf4Q9QZS2 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms