Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZQ0

Npas3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas3Q9QZQ0 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Npas3Q9QZQ0 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Npas3Q9QZQ0 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Npas3Q9QZQ0 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Npas3Q9QZQ0 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Npas3Q9QZQ0 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Npas3Q9QZQ0 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Npas3Q9QZQ0 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Npas3Q9QZQ0 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Npas3Q9QZQ0 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Npas3Q9QZQ0 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Npas3Q9QZQ0 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Npas3Q9QZQ0 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Npas3Q9QZQ0 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Npas3Q9QZQ0 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Npas3Q9QZQ0 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Npas3Q9QZQ0 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Npas3Q9QZQ0 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Npas3Q9QZQ0 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Npas3Q9QZQ0 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Npas3Q9QZQ0 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Npas3Q9QZQ0 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Npas3Q9QZQ0 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Npas3Q9QZQ0 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Npas3Q9QZQ0 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Npas3Q9QZQ0 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Npas3Q9QZQ0 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Npas3Q9QZQ0 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Npas3Q9QZQ0 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Npas3Q9QZQ0 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Npas3Q9QZQ0 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Npas3Q9QZQ0 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Npas3Q9QZQ0 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Npas3Q9QZQ0 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Npas3Q9QZQ0 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Npas3Q9QZQ0 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Npas3Q9QZQ0 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Npas3Q9QZQ0 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Npas3Q9QZQ0 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Npas3Q9QZQ0 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Npas3Q9QZQ0 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Npas3Q9QZQ0 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Npas3Q9QZQ0 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Npas3Q9QZQ0 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Npas3Q9QZQ0 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Npas3Q9QZQ0 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Npas3Q9QZQ0 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Npas3Q9QZQ0 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Npas3Q9QZQ0 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Npas3Q9QZQ0 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Npas3Q9QZQ0 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Npas3Q9QZQ0 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Npas3Q9QZQ0 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Npas3Q9QZQ0 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Npas3Q9QZQ0 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Npas3Q9QZQ0 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Npas3Q9QZQ0 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Npas3Q9QZQ0 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Npas3Q9QZQ0 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Npas3Q9QZQ0 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Npas3Q9QZQ0 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Npas3Q9QZQ0 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Npas3Q9QZQ0 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Npas3Q9QZQ0 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Npas3Q9QZQ0 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Npas3Q9QZQ0 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Npas3Q9QZQ0 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Npas3Q9QZQ0 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Npas3Q9QZQ0 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Npas3Q9QZQ0 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Npas3Q9QZQ0 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Npas3Q9QZQ0 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Npas3Q9QZQ0 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Npas3Q9QZQ0 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Npas3Q9QZQ0 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Npas3Q9QZQ0 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Npas3Q9QZQ0 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Npas3Q9QZQ0 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Npas3Q9QZQ0 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Npas3Q9QZQ0 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Npas3Q9QZQ0 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Npas3Q9QZQ0 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Npas3Q9QZQ0 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Npas3Q9QZQ0 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Npas3Q9QZQ0 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Npas3Q9QZQ0 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Npas3Q9QZQ0 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Npas3Q9QZQ0 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Npas3Q9QZQ0 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Npas3Q9QZQ0 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Npas3Q9QZQ0 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Npas3Q9QZQ0 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Npas3Q9QZQ0 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Npas3Q9QZQ0 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Npas3Q9QZQ0 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Npas3Q9QZQ0 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Npas3Q9QZQ0 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Npas3Q9QZQ0 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Npas3Q9QZQ0 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Npas3Q9QZQ0 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms