Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZM4

Tnfrsf10b, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 10B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Tnfrsf10bQ9QZM4 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfrsf10bQ9QZM4 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfrsf10bQ9QZM4 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfrsf10bQ9QZM4 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfrsf10bQ9QZM4 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfrsf10bQ9QZM4 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfrsf10bQ9QZM4 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfrsf10bQ9QZM4 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfrsf10bQ9QZM4 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfrsf10bQ9QZM4 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfrsf10bQ9QZM4 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfrsf10bQ9QZM4 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfrsf10bQ9QZM4 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfrsf10bQ9QZM4 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfrsf10bQ9QZM4 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfrsf10bQ9QZM4 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfrsf10bQ9QZM4 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfrsf10bQ9QZM4 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfrsf10bQ9QZM4 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfrsf10bQ9QZM4 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfrsf10bQ9QZM4 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfrsf10bQ9QZM4 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfrsf10bQ9QZM4 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfrsf10bQ9QZM4 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfrsf10bQ9QZM4 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfrsf10bQ9QZM4 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfrsf10bQ9QZM4 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfrsf10bQ9QZM4 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfrsf10bQ9QZM4 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfrsf10bQ9QZM4 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfrsf10bQ9QZM4 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfrsf10bQ9QZM4 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms