Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZF2

Gpc1, Glypican-1, mousemouse

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Length 557 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc1Q9QZF2 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
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Gpc1Q9QZF2 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gpc1Q9QZF2 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gpc1Q9QZF2 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gpc1Q9QZF2 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gpc1Q9QZF2 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gpc1Q9QZF2 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gpc1Q9QZF2 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gpc1Q9QZF2 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gpc1Q9QZF2 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gpc1Q9QZF2 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gpc1Q9QZF2 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gpc1Q9QZF2 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gpc1Q9QZF2 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gpc1Q9QZF2 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gpc1Q9QZF2 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gpc1Q9QZF2 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gpc1Q9QZF2 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gpc1Q9QZF2 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gpc1Q9QZF2 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gpc1Q9QZF2 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gpc1Q9QZF2 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gpc1Q9QZF2 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gpc1Q9QZF2 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gpc1Q9QZF2 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gpc1Q9QZF2 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gpc1Q9QZF2 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gpc1Q9QZF2 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gpc1Q9QZF2 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gpc1Q9QZF2 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gpc1Q9QZF2 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gpc1Q9QZF2 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gpc1Q9QZF2 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gpc1Q9QZF2 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gpc1Q9QZF2 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gpc1Q9QZF2 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gpc1Q9QZF2 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gpc1Q9QZF2 Gm37720-201ENSMUST00000195497 1241 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Gpc1Q9QZF2 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gpc1Q9QZF2 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gpc1Q9QZF2 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gpc1Q9QZF2 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gpc1Q9QZF2 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gpc1Q9QZF2 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gpc1Q9QZF2 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gpc1Q9QZF2 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gpc1Q9QZF2 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gpc1Q9QZF2 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gpc1Q9QZF2 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gpc1Q9QZF2 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gpc1Q9QZF2 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gpc1Q9QZF2 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gpc1Q9QZF2 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Gpc1Q9QZF2 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Gpc1Q9QZF2 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gpc1Q9QZF2 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gpc1Q9QZF2 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gpc1Q9QZF2 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gpc1Q9QZF2 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Gpc1Q9QZF2 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Gpc1Q9QZF2 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gpc1Q9QZF2 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gpc1Q9QZF2 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gpc1Q9QZF2 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gpc1Q9QZF2 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gpc1Q9QZF2 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gpc1Q9QZF2 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gpc1Q9QZF2 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gpc1Q9QZF2 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gpc1Q9QZF2 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gpc1Q9QZF2 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gpc1Q9QZF2 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gpc1Q9QZF2 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gpc1Q9QZF2 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gpc1Q9QZF2 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gpc1Q9QZF2 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Gpc1Q9QZF2 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gpc1Q9QZF2 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gpc1Q9QZF2 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gpc1Q9QZF2 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gpc1Q9QZF2 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gpc1Q9QZF2 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gpc1Q9QZF2 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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