Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ88

Vps29, Vacuolar protein sorting-associated protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps29Q9QZ88 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vps29Q9QZ88 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vps29Q9QZ88 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vps29Q9QZ88 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vps29Q9QZ88 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vps29Q9QZ88 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vps29Q9QZ88 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vps29Q9QZ88 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vps29Q9QZ88 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vps29Q9QZ88 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vps29Q9QZ88 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vps29Q9QZ88 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vps29Q9QZ88 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vps29Q9QZ88 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vps29Q9QZ88 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vps29Q9QZ88 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vps29Q9QZ88 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vps29Q9QZ88 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vps29Q9QZ88 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vps29Q9QZ88 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vps29Q9QZ88 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vps29Q9QZ88 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vps29Q9QZ88 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vps29Q9QZ88 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vps29Q9QZ88 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vps29Q9QZ88 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vps29Q9QZ88 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vps29Q9QZ88 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vps29Q9QZ88 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vps29Q9QZ88 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vps29Q9QZ88 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vps29Q9QZ88 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Vps29Q9QZ88 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vps29Q9QZ88 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vps29Q9QZ88 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vps29Q9QZ88 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vps29Q9QZ88 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vps29Q9QZ88 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vps29Q9QZ88 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vps29Q9QZ88 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vps29Q9QZ88 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vps29Q9QZ88 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Vps29Q9QZ88 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vps29Q9QZ88 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vps29Q9QZ88 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vps29Q9QZ88 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vps29Q9QZ88 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vps29Q9QZ88 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vps29Q9QZ88 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vps29Q9QZ88 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vps29Q9QZ88 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vps29Q9QZ88 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vps29Q9QZ88 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vps29Q9QZ88 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vps29Q9QZ88 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vps29Q9QZ88 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vps29Q9QZ88 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vps29Q9QZ88 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Vps29Q9QZ88 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vps29Q9QZ88 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Vps29Q9QZ88 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vps29Q9QZ88 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vps29Q9QZ88 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vps29Q9QZ88 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vps29Q9QZ88 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vps29Q9QZ88 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vps29Q9QZ88 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vps29Q9QZ88 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vps29Q9QZ88 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vps29Q9QZ88 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vps29Q9QZ88 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vps29Q9QZ88 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vps29Q9QZ88 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vps29Q9QZ88 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vps29Q9QZ88 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vps29Q9QZ88 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vps29Q9QZ88 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vps29Q9QZ88 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vps29Q9QZ88 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vps29Q9QZ88 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vps29Q9QZ88 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vps29Q9QZ88 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vps29Q9QZ88 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vps29Q9QZ88 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Vps29Q9QZ88 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vps29Q9QZ88 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vps29Q9QZ88 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vps29Q9QZ88 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vps29Q9QZ88 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Vps29Q9QZ88 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Vps29Q9QZ88 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vps29Q9QZ88 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vps29Q9QZ88 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vps29Q9QZ88 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vps29Q9QZ88 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vps29Q9QZ88 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vps29Q9QZ88 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vps29Q9QZ88 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vps29Q9QZ88 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vps29Q9QZ88 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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