Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ28

Six6, Homeobox protein SIX6, mousemouse

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Length 246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six6Q9QZ28 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Six6Q9QZ28 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Six6Q9QZ28 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Six6Q9QZ28 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Six6Q9QZ28 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Six6Q9QZ28 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Six6Q9QZ28 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Six6Q9QZ28 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Six6Q9QZ28 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Six6Q9QZ28 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Six6Q9QZ28 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Six6Q9QZ28 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Six6Q9QZ28 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Six6Q9QZ28 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Six6Q9QZ28 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Six6Q9QZ28 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Six6Q9QZ28 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Six6Q9QZ28 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Six6Q9QZ28 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Six6Q9QZ28 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Six6Q9QZ28 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Six6Q9QZ28 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Six6Q9QZ28 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Six6Q9QZ28 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Six6Q9QZ28 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Six6Q9QZ28 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Six6Q9QZ28 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Six6Q9QZ28 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Six6Q9QZ28 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Six6Q9QZ28 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Six6Q9QZ28 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Six6Q9QZ28 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Six6Q9QZ28 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Six6Q9QZ28 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Six6Q9QZ28 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Six6Q9QZ28 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Six6Q9QZ28 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Six6Q9QZ28 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Six6Q9QZ28 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Six6Q9QZ28 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Six6Q9QZ28 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Six6Q9QZ28 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Six6Q9QZ28 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Six6Q9QZ28 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Six6Q9QZ28 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Six6Q9QZ28 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Six6Q9QZ28 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Six6Q9QZ28 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Six6Q9QZ28 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Six6Q9QZ28 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Six6Q9QZ28 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Six6Q9QZ28 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Six6Q9QZ28 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Six6Q9QZ28 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Six6Q9QZ28 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Six6Q9QZ28 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Six6Q9QZ28 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Six6Q9QZ28 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Six6Q9QZ28 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Six6Q9QZ28 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Six6Q9QZ28 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Six6Q9QZ28 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Six6Q9QZ28 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Six6Q9QZ28 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Six6Q9QZ28 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Six6Q9QZ28 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Six6Q9QZ28 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Six6Q9QZ28 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Six6Q9QZ28 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Six6Q9QZ28 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Six6Q9QZ28 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Six6Q9QZ28 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Six6Q9QZ28 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Six6Q9QZ28 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Six6Q9QZ28 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Six6Q9QZ28 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Six6Q9QZ28 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Six6Q9QZ28 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Six6Q9QZ28 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Six6Q9QZ28 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Six6Q9QZ28 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Six6Q9QZ28 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Six6Q9QZ28 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Six6Q9QZ28 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Six6Q9QZ28 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Six6Q9QZ28 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Six6Q9QZ28 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Six6Q9QZ28 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Six6Q9QZ28 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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