Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYF1

Rdh11, Retinol dehydrogenase 11, mousemouse

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh11Q9QYF1 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rdh11Q9QYF1 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rdh11Q9QYF1 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rdh11Q9QYF1 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rdh11Q9QYF1 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rdh11Q9QYF1 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rdh11Q9QYF1 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rdh11Q9QYF1 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rdh11Q9QYF1 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rdh11Q9QYF1 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rdh11Q9QYF1 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rdh11Q9QYF1 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rdh11Q9QYF1 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rdh11Q9QYF1 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rdh11Q9QYF1 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rdh11Q9QYF1 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rdh11Q9QYF1 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rdh11Q9QYF1 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rdh11Q9QYF1 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rdh11Q9QYF1 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rdh11Q9QYF1 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rdh11Q9QYF1 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rdh11Q9QYF1 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rdh11Q9QYF1 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rdh11Q9QYF1 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rdh11Q9QYF1 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rdh11Q9QYF1 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rdh11Q9QYF1 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rdh11Q9QYF1 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rdh11Q9QYF1 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rdh11Q9QYF1 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rdh11Q9QYF1 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rdh11Q9QYF1 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rdh11Q9QYF1 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rdh11Q9QYF1 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rdh11Q9QYF1 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rdh11Q9QYF1 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rdh11Q9QYF1 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rdh11Q9QYF1 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rdh11Q9QYF1 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rdh11Q9QYF1 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rdh11Q9QYF1 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Rdh11Q9QYF1 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rdh11Q9QYF1 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rdh11Q9QYF1 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Rdh11Q9QYF1 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rdh11Q9QYF1 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rdh11Q9QYF1 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rdh11Q9QYF1 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rdh11Q9QYF1 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rdh11Q9QYF1 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rdh11Q9QYF1 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rdh11Q9QYF1 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rdh11Q9QYF1 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rdh11Q9QYF1 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rdh11Q9QYF1 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rdh11Q9QYF1 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rdh11Q9QYF1 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rdh11Q9QYF1 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rdh11Q9QYF1 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Rdh11Q9QYF1 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rdh11Q9QYF1 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rdh11Q9QYF1 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rdh11Q9QYF1 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Rdh11Q9QYF1 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rdh11Q9QYF1 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Rdh11Q9QYF1 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rdh11Q9QYF1 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Rdh11Q9QYF1 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rdh11Q9QYF1 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rdh11Q9QYF1 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rdh11Q9QYF1 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rdh11Q9QYF1 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rdh11Q9QYF1 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rdh11Q9QYF1 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rdh11Q9QYF1 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rdh11Q9QYF1 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rdh11Q9QYF1 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rdh11Q9QYF1 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rdh11Q9QYF1 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rdh11Q9QYF1 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rdh11Q9QYF1 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rdh11Q9QYF1 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rdh11Q9QYF1 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rdh11Q9QYF1 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rdh11Q9QYF1 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rdh11Q9QYF1 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rdh11Q9QYF1 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rdh11Q9QYF1 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rdh11Q9QYF1 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rdh11Q9QYF1 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
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