Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY76

Vapb, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapbQ9QY76 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VapbQ9QY76 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VapbQ9QY76 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VapbQ9QY76 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VapbQ9QY76 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VapbQ9QY76 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VapbQ9QY76 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VapbQ9QY76 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VapbQ9QY76 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VapbQ9QY76 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VapbQ9QY76 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VapbQ9QY76 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VapbQ9QY76 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VapbQ9QY76 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VapbQ9QY76 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VapbQ9QY76 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VapbQ9QY76 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VapbQ9QY76 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VapbQ9QY76 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VapbQ9QY76 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VapbQ9QY76 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VapbQ9QY76 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VapbQ9QY76 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VapbQ9QY76 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VapbQ9QY76 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
VapbQ9QY76 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VapbQ9QY76 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VapbQ9QY76 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VapbQ9QY76 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VapbQ9QY76 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VapbQ9QY76 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VapbQ9QY76 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VapbQ9QY76 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VapbQ9QY76 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VapbQ9QY76 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VapbQ9QY76 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VapbQ9QY76 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VapbQ9QY76 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VapbQ9QY76 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VapbQ9QY76 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VapbQ9QY76 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VapbQ9QY76 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VapbQ9QY76 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VapbQ9QY76 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VapbQ9QY76 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VapbQ9QY76 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VapbQ9QY76 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VapbQ9QY76 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
VapbQ9QY76 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VapbQ9QY76 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VapbQ9QY76 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VapbQ9QY76 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
VapbQ9QY76 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
VapbQ9QY76 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VapbQ9QY76 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VapbQ9QY76 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VapbQ9QY76 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VapbQ9QY76 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VapbQ9QY76 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VapbQ9QY76 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VapbQ9QY76 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VapbQ9QY76 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VapbQ9QY76 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VapbQ9QY76 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VapbQ9QY76 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VapbQ9QY76 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VapbQ9QY76 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VapbQ9QY76 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VapbQ9QY76 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VapbQ9QY76 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VapbQ9QY76 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VapbQ9QY76 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VapbQ9QY76 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VapbQ9QY76 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VapbQ9QY76 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VapbQ9QY76 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VapbQ9QY76 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VapbQ9QY76 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VapbQ9QY76 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VapbQ9QY76 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VapbQ9QY76 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
VapbQ9QY76 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VapbQ9QY76 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VapbQ9QY76 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VapbQ9QY76 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VapbQ9QY76 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VapbQ9QY76 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VapbQ9QY76 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
VapbQ9QY76 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VapbQ9QY76 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VapbQ9QY76 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VapbQ9QY76 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
VapbQ9QY76 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VapbQ9QY76 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VapbQ9QY76 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
VapbQ9QY76 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VapbQ9QY76 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VapbQ9QY76 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VapbQ9QY76 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VapbQ9QY76 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms