Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ7

Nr2e3, Photoreceptor-specific nuclear receptor, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2e3Q9QXZ7 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nr2e3Q9QXZ7 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nr2e3Q9QXZ7 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nr2e3Q9QXZ7 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nr2e3Q9QXZ7 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nr2e3Q9QXZ7 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nr2e3Q9QXZ7 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nr2e3Q9QXZ7 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nr2e3Q9QXZ7 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nr2e3Q9QXZ7 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nr2e3Q9QXZ7 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Nr2e3Q9QXZ7 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Nr2e3Q9QXZ7 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Nr2e3Q9QXZ7 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nr2e3Q9QXZ7 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nr2e3Q9QXZ7 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Nr2e3Q9QXZ7 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nr2e3Q9QXZ7 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nr2e3Q9QXZ7 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nr2e3Q9QXZ7 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nr2e3Q9QXZ7 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nr2e3Q9QXZ7 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nr2e3Q9QXZ7 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nr2e3Q9QXZ7 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nr2e3Q9QXZ7 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nr2e3Q9QXZ7 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nr2e3Q9QXZ7 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nr2e3Q9QXZ7 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nr2e3Q9QXZ7 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nr2e3Q9QXZ7 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nr2e3Q9QXZ7 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nr2e3Q9QXZ7 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nr2e3Q9QXZ7 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nr2e3Q9QXZ7 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nr2e3Q9QXZ7 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nr2e3Q9QXZ7 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nr2e3Q9QXZ7 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nr2e3Q9QXZ7 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nr2e3Q9QXZ7 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nr2e3Q9QXZ7 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nr2e3Q9QXZ7 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nr2e3Q9QXZ7 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nr2e3Q9QXZ7 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nr2e3Q9QXZ7 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nr2e3Q9QXZ7 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nr2e3Q9QXZ7 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Nr2e3Q9QXZ7 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nr2e3Q9QXZ7 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nr2e3Q9QXZ7 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nr2e3Q9QXZ7 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nr2e3Q9QXZ7 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nr2e3Q9QXZ7 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nr2e3Q9QXZ7 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nr2e3Q9QXZ7 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nr2e3Q9QXZ7 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nr2e3Q9QXZ7 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nr2e3Q9QXZ7 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nr2e3Q9QXZ7 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nr2e3Q9QXZ7 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nr2e3Q9QXZ7 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nr2e3Q9QXZ7 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nr2e3Q9QXZ7 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Nr2e3Q9QXZ7 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Nr2e3Q9QXZ7 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nr2e3Q9QXZ7 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Nr2e3Q9QXZ7 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Nr2e3Q9QXZ7 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nr2e3Q9QXZ7 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nr2e3Q9QXZ7 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nr2e3Q9QXZ7 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nr2e3Q9QXZ7 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nr2e3Q9QXZ7 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nr2e3Q9QXZ7 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nr2e3Q9QXZ7 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nr2e3Q9QXZ7 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nr2e3Q9QXZ7 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nr2e3Q9QXZ7 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nr2e3Q9QXZ7 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nr2e3Q9QXZ7 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nr2e3Q9QXZ7 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nr2e3Q9QXZ7 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nr2e3Q9QXZ7 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nr2e3Q9QXZ7 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nr2e3Q9QXZ7 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nr2e3Q9QXZ7 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nr2e3Q9QXZ7 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nr2e3Q9QXZ7 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nr2e3Q9QXZ7 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nr2e3Q9QXZ7 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nr2e3Q9QXZ7 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nr2e3Q9QXZ7 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nr2e3Q9QXZ7 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nr2e3Q9QXZ7 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nr2e3Q9QXZ7 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nr2e3Q9QXZ7 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nr2e3Q9QXZ7 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nr2e3Q9QXZ7 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nr2e3Q9QXZ7 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nr2e3Q9QXZ7 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nr2e3Q9QXZ7 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 260.9 ms