Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV0

Pcsk1n, ProSAAS, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk1nQ9QXV0 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pcsk1nQ9QXV0 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pcsk1nQ9QXV0 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pcsk1nQ9QXV0 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pcsk1nQ9QXV0 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pcsk1nQ9QXV0 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pcsk1nQ9QXV0 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pcsk1nQ9QXV0 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pcsk1nQ9QXV0 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pcsk1nQ9QXV0 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pcsk1nQ9QXV0 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pcsk1nQ9QXV0 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pcsk1nQ9QXV0 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pcsk1nQ9QXV0 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pcsk1nQ9QXV0 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pcsk1nQ9QXV0 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pcsk1nQ9QXV0 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pcsk1nQ9QXV0 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pcsk1nQ9QXV0 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pcsk1nQ9QXV0 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Pcsk1nQ9QXV0 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pcsk1nQ9QXV0 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Pcsk1nQ9QXV0 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pcsk1nQ9QXV0 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Pcsk1nQ9QXV0 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pcsk1nQ9QXV0 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pcsk1nQ9QXV0 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pcsk1nQ9QXV0 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pcsk1nQ9QXV0 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pcsk1nQ9QXV0 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pcsk1nQ9QXV0 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Pcsk1nQ9QXV0 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pcsk1nQ9QXV0 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pcsk1nQ9QXV0 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pcsk1nQ9QXV0 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pcsk1nQ9QXV0 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pcsk1nQ9QXV0 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pcsk1nQ9QXV0 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pcsk1nQ9QXV0 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pcsk1nQ9QXV0 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pcsk1nQ9QXV0 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pcsk1nQ9QXV0 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Pcsk1nQ9QXV0 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pcsk1nQ9QXV0 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Pcsk1nQ9QXV0 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pcsk1nQ9QXV0 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pcsk1nQ9QXV0 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pcsk1nQ9QXV0 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pcsk1nQ9QXV0 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Pcsk1nQ9QXV0 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pcsk1nQ9QXV0 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pcsk1nQ9QXV0 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pcsk1nQ9QXV0 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pcsk1nQ9QXV0 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pcsk1nQ9QXV0 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pcsk1nQ9QXV0 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pcsk1nQ9QXV0 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pcsk1nQ9QXV0 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pcsk1nQ9QXV0 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pcsk1nQ9QXV0 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pcsk1nQ9QXV0 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Pcsk1nQ9QXV0 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Pcsk1nQ9QXV0 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pcsk1nQ9QXV0 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pcsk1nQ9QXV0 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pcsk1nQ9QXV0 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pcsk1nQ9QXV0 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pcsk1nQ9QXV0 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pcsk1nQ9QXV0 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pcsk1nQ9QXV0 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pcsk1nQ9QXV0 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pcsk1nQ9QXV0 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pcsk1nQ9QXV0 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pcsk1nQ9QXV0 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pcsk1nQ9QXV0 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pcsk1nQ9QXV0 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pcsk1nQ9QXV0 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pcsk1nQ9QXV0 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pcsk1nQ9QXV0 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pcsk1nQ9QXV0 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pcsk1nQ9QXV0 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pcsk1nQ9QXV0 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pcsk1nQ9QXV0 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pcsk1nQ9QXV0 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pcsk1nQ9QXV0 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pcsk1nQ9QXV0 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pcsk1nQ9QXV0 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pcsk1nQ9QXV0 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pcsk1nQ9QXV0 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pcsk1nQ9QXV0 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pcsk1nQ9QXV0 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Pcsk1nQ9QXV0 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pcsk1nQ9QXV0 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pcsk1nQ9QXV0 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pcsk1nQ9QXV0 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pcsk1nQ9QXV0 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pcsk1nQ9QXV0 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pcsk1nQ9QXV0 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pcsk1nQ9QXV0 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pcsk1nQ9QXV0 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms