Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXN3

Trip4, Activating signal cointegrator 1, mousemouse

Predictions only

Length 581 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip4Q9QXN3 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Trip4Q9QXN3 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trip4Q9QXN3 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trip4Q9QXN3 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Trip4Q9QXN3 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trip4Q9QXN3 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trip4Q9QXN3 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trip4Q9QXN3 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trip4Q9QXN3 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trip4Q9QXN3 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trip4Q9QXN3 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trip4Q9QXN3 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trip4Q9QXN3 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trip4Q9QXN3 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trip4Q9QXN3 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trip4Q9QXN3 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trip4Q9QXN3 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trip4Q9QXN3 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trip4Q9QXN3 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trip4Q9QXN3 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trip4Q9QXN3 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trip4Q9QXN3 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trip4Q9QXN3 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Trip4Q9QXN3 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trip4Q9QXN3 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trip4Q9QXN3 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trip4Q9QXN3 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trip4Q9QXN3 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trip4Q9QXN3 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trip4Q9QXN3 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trip4Q9QXN3 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trip4Q9QXN3 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trip4Q9QXN3 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trip4Q9QXN3 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trip4Q9QXN3 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trip4Q9QXN3 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trip4Q9QXN3 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trip4Q9QXN3 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trip4Q9QXN3 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trip4Q9QXN3 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trip4Q9QXN3 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trip4Q9QXN3 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trip4Q9QXN3 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trip4Q9QXN3 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trip4Q9QXN3 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trip4Q9QXN3 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trip4Q9QXN3 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trip4Q9QXN3 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trip4Q9QXN3 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trip4Q9QXN3 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trip4Q9QXN3 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trip4Q9QXN3 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Trip4Q9QXN3 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trip4Q9QXN3 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Trip4Q9QXN3 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trip4Q9QXN3 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trip4Q9QXN3 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trip4Q9QXN3 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trip4Q9QXN3 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trip4Q9QXN3 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trip4Q9QXN3 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Trip4Q9QXN3 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trip4Q9QXN3 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trip4Q9QXN3 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trip4Q9QXN3 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trip4Q9QXN3 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.14
Trip4Q9QXN3 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trip4Q9QXN3 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trip4Q9QXN3 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Trip4Q9QXN3 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trip4Q9QXN3 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trip4Q9QXN3 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trip4Q9QXN3 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Trip4Q9QXN3 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trip4Q9QXN3 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trip4Q9QXN3 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Trip4Q9QXN3 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trip4Q9QXN3 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trip4Q9QXN3 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trip4Q9QXN3 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trip4Q9QXN3 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trip4Q9QXN3 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trip4Q9QXN3 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trip4Q9QXN3 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trip4Q9QXN3 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trip4Q9QXN3 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Trip4Q9QXN3 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trip4Q9QXN3 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trip4Q9QXN3 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trip4Q9QXN3 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trip4Q9QXN3 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trip4Q9QXN3 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trip4Q9QXN3 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trip4Q9QXN3 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trip4Q9QXN3 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trip4Q9QXN3 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trip4Q9QXN3 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Trip4Q9QXN3 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trip4Q9QXN3 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms