Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ChmQ9QXG2 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ChmQ9QXG2 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ChmQ9QXG2 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ChmQ9QXG2 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ChmQ9QXG2 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ChmQ9QXG2 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ChmQ9QXG2 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ChmQ9QXG2 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ChmQ9QXG2 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ChmQ9QXG2 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ChmQ9QXG2 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ChmQ9QXG2 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ChmQ9QXG2 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ChmQ9QXG2 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ChmQ9QXG2 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ChmQ9QXG2 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ChmQ9QXG2 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ChmQ9QXG2 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ChmQ9QXG2 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ChmQ9QXG2 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ChmQ9QXG2 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ChmQ9QXG2 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ChmQ9QXG2 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ChmQ9QXG2 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ChmQ9QXG2 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ChmQ9QXG2 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ChmQ9QXG2 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ChmQ9QXG2 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ChmQ9QXG2 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ChmQ9QXG2 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ChmQ9QXG2 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ChmQ9QXG2 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ChmQ9QXG2 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ChmQ9QXG2 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ChmQ9QXG2 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ChmQ9QXG2 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ChmQ9QXG2 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ChmQ9QXG2 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ChmQ9QXG2 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ChmQ9QXG2 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ChmQ9QXG2 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ChmQ9QXG2 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ChmQ9QXG2 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ChmQ9QXG2 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ChmQ9QXG2 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ChmQ9QXG2 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ChmQ9QXG2 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ChmQ9QXG2 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ChmQ9QXG2 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ChmQ9QXG2 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ChmQ9QXG2 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ChmQ9QXG2 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ChmQ9QXG2 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ChmQ9QXG2 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ChmQ9QXG2 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ChmQ9QXG2 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ChmQ9QXG2 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ChmQ9QXG2 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ChmQ9QXG2 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ChmQ9QXG2 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ChmQ9QXG2 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ChmQ9QXG2 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ChmQ9QXG2 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ChmQ9QXG2 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ChmQ9QXG2 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ChmQ9QXG2 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ChmQ9QXG2 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ChmQ9QXG2 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ChmQ9QXG2 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ChmQ9QXG2 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ChmQ9QXG2 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ChmQ9QXG2 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ChmQ9QXG2 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ChmQ9QXG2 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ChmQ9QXG2 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ChmQ9QXG2 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ChmQ9QXG2 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ChmQ9QXG2 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ChmQ9QXG2 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ChmQ9QXG2 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ChmQ9QXG2 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ChmQ9QXG2 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ChmQ9QXG2 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ChmQ9QXG2 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ChmQ9QXG2 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ChmQ9QXG2 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ChmQ9QXG2 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ChmQ9QXG2 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ChmQ9QXG2 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ChmQ9QXG2 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ChmQ9QXG2 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ChmQ9QXG2 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ChmQ9QXG2 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ChmQ9QXG2 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ChmQ9QXG2 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ChmQ9QXG2 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ChmQ9QXG2 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ChmQ9QXG2 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ChmQ9QXG2 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms