Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWV1

H2-Oa, H2-O alpha, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-OaQ9QWV1 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2-OaQ9QWV1 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2-OaQ9QWV1 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2-OaQ9QWV1 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2-OaQ9QWV1 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2-OaQ9QWV1 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2-OaQ9QWV1 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2-OaQ9QWV1 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2-OaQ9QWV1 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2-OaQ9QWV1 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2-OaQ9QWV1 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2-OaQ9QWV1 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2-OaQ9QWV1 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2-OaQ9QWV1 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2-OaQ9QWV1 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2-OaQ9QWV1 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2-OaQ9QWV1 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2-OaQ9QWV1 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2-OaQ9QWV1 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2-OaQ9QWV1 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2-OaQ9QWV1 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2-OaQ9QWV1 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-OaQ9QWV1 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-OaQ9QWV1 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-OaQ9QWV1 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-OaQ9QWV1 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-OaQ9QWV1 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-OaQ9QWV1 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-OaQ9QWV1 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-OaQ9QWV1 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-OaQ9QWV1 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-OaQ9QWV1 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-OaQ9QWV1 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-OaQ9QWV1 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-OaQ9QWV1 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-OaQ9QWV1 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-OaQ9QWV1 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-OaQ9QWV1 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-OaQ9QWV1 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-OaQ9QWV1 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-OaQ9QWV1 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-OaQ9QWV1 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-OaQ9QWV1 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-OaQ9QWV1 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-OaQ9QWV1 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-OaQ9QWV1 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-OaQ9QWV1 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-OaQ9QWV1 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-OaQ9QWV1 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-OaQ9QWV1 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-OaQ9QWV1 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-OaQ9QWV1 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-OaQ9QWV1 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-OaQ9QWV1 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-OaQ9QWV1 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-OaQ9QWV1 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-OaQ9QWV1 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-OaQ9QWV1 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-OaQ9QWV1 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-OaQ9QWV1 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-OaQ9QWV1 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-OaQ9QWV1 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-OaQ9QWV1 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-OaQ9QWV1 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-OaQ9QWV1 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-OaQ9QWV1 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-OaQ9QWV1 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-OaQ9QWV1 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-OaQ9QWV1 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-OaQ9QWV1 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-OaQ9QWV1 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-OaQ9QWV1 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-OaQ9QWV1 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-OaQ9QWV1 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-OaQ9QWV1 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-OaQ9QWV1 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-OaQ9QWV1 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-OaQ9QWV1 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-OaQ9QWV1 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-OaQ9QWV1 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-OaQ9QWV1 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-OaQ9QWV1 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-OaQ9QWV1 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-OaQ9QWV1 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-OaQ9QWV1 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-OaQ9QWV1 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-OaQ9QWV1 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-OaQ9QWV1 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-OaQ9QWV1 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-OaQ9QWV1 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-OaQ9QWV1 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-OaQ9QWV1 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2-OaQ9QWV1 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2-OaQ9QWV1 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2-OaQ9QWV1 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2-OaQ9QWV1 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2-OaQ9QWV1 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2-OaQ9QWV1 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2-OaQ9QWV1 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2-OaQ9QWV1 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms