Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUM7

Msh5, MutS protein homolog 5, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msh5Q9QUM7 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Msh5Q9QUM7 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Msh5Q9QUM7 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Msh5Q9QUM7 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Msh5Q9QUM7 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Msh5Q9QUM7 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Msh5Q9QUM7 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Msh5Q9QUM7 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Msh5Q9QUM7 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Msh5Q9QUM7 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Msh5Q9QUM7 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Msh5Q9QUM7 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Msh5Q9QUM7 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Msh5Q9QUM7 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Msh5Q9QUM7 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Msh5Q9QUM7 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Msh5Q9QUM7 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Msh5Q9QUM7 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Msh5Q9QUM7 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Msh5Q9QUM7 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Msh5Q9QUM7 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Msh5Q9QUM7 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Msh5Q9QUM7 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Msh5Q9QUM7 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Msh5Q9QUM7 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Msh5Q9QUM7 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Msh5Q9QUM7 Hormad1-201ENSMUST00000029754 1385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Msh5Q9QUM7 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Msh5Q9QUM7 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Msh5Q9QUM7 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Msh5Q9QUM7 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Msh5Q9QUM7 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Msh5Q9QUM7 Nr6a1os-201ENSMUST00000129089 645 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Msh5Q9QUM7 Gm26812-202ENSMUST00000181776 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Msh5Q9QUM7 Gm37073-201ENSMUST00000192469 1222 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Msh5Q9QUM7 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Msh5Q9QUM7 Gm19324-201ENSMUST00000213229 1169 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Msh5Q9QUM7 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Msh5Q9QUM7 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Msh5Q9QUM7 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Msh5Q9QUM7 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Msh5Q9QUM7 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Msh5Q9QUM7 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Msh5Q9QUM7 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Msh5Q9QUM7 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Msh5Q9QUM7 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Msh5Q9QUM7 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Msh5Q9QUM7 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Msh5Q9QUM7 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Msh5Q9QUM7 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Msh5Q9QUM7 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Msh5Q9QUM7 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Msh5Q9QUM7 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Msh5Q9QUM7 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Msh5Q9QUM7 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Msh5Q9QUM7 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Msh5Q9QUM7 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Msh5Q9QUM7 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Msh5Q9QUM7 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Msh5Q9QUM7 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Msh5Q9QUM7 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Msh5Q9QUM7 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Msh5Q9QUM7 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Msh5Q9QUM7 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Msh5Q9QUM7 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Msh5Q9QUM7 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Msh5Q9QUM7 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Msh5Q9QUM7 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Msh5Q9QUM7 Xlr-203ENSMUST00000114810 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Msh5Q9QUM7 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Msh5Q9QUM7 Vmn1r185-201ENSMUST00000171039 1144 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Msh5Q9QUM7 Gm42474-201ENSMUST00000201073 505 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Msh5Q9QUM7 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Msh5Q9QUM7 E330011O21Rik-205ENSMUST00000211317 1062 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Msh5Q9QUM7 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Msh5Q9QUM7 Olfr1212-201ENSMUST00000055895 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Msh5Q9QUM7 Xlr-201ENSMUST00000067763 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Msh5Q9QUM7 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Msh5Q9QUM7 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Msh5Q9QUM7 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Msh5Q9QUM7 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Msh5Q9QUM7 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Msh5Q9QUM7 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Msh5Q9QUM7 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Msh5Q9QUM7 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Msh5Q9QUM7 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Msh5Q9QUM7 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Msh5Q9QUM7 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Msh5Q9QUM7 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Msh5Q9QUM7 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Msh5Q9QUM7 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Msh5Q9QUM7 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Msh5Q9QUM7 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Msh5Q9QUM7 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Msh5Q9QUM7 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Msh5Q9QUM7 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Msh5Q9QUM7 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Msh5Q9QUM7 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Msh5Q9QUM7 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Msh5Q9QUM7 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms