Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLQ0

Cd2ap, CD2-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd2apQ9JLQ0 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd2apQ9JLQ0 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd2apQ9JLQ0 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd2apQ9JLQ0 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd2apQ9JLQ0 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd2apQ9JLQ0 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd2apQ9JLQ0 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd2apQ9JLQ0 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd2apQ9JLQ0 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd2apQ9JLQ0 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd2apQ9JLQ0 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd2apQ9JLQ0 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd2apQ9JLQ0 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd2apQ9JLQ0 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd2apQ9JLQ0 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd2apQ9JLQ0 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd2apQ9JLQ0 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd2apQ9JLQ0 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd2apQ9JLQ0 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd2apQ9JLQ0 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd2apQ9JLQ0 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd2apQ9JLQ0 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd2apQ9JLQ0 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd2apQ9JLQ0 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd2apQ9JLQ0 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd2apQ9JLQ0 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd2apQ9JLQ0 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd2apQ9JLQ0 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd2apQ9JLQ0 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd2apQ9JLQ0 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd2apQ9JLQ0 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd2apQ9JLQ0 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd2apQ9JLQ0 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd2apQ9JLQ0 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd2apQ9JLQ0 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd2apQ9JLQ0 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd2apQ9JLQ0 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd2apQ9JLQ0 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd2apQ9JLQ0 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd2apQ9JLQ0 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd2apQ9JLQ0 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd2apQ9JLQ0 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd2apQ9JLQ0 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd2apQ9JLQ0 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd2apQ9JLQ0 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd2apQ9JLQ0 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd2apQ9JLQ0 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd2apQ9JLQ0 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd2apQ9JLQ0 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd2apQ9JLQ0 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd2apQ9JLQ0 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd2apQ9JLQ0 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd2apQ9JLQ0 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd2apQ9JLQ0 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd2apQ9JLQ0 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd2apQ9JLQ0 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd2apQ9JLQ0 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd2apQ9JLQ0 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd2apQ9JLQ0 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd2apQ9JLQ0 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd2apQ9JLQ0 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd2apQ9JLQ0 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd2apQ9JLQ0 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd2apQ9JLQ0 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd2apQ9JLQ0 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd2apQ9JLQ0 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd2apQ9JLQ0 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd2apQ9JLQ0 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd2apQ9JLQ0 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd2apQ9JLQ0 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd2apQ9JLQ0 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd2apQ9JLQ0 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd2apQ9JLQ0 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd2apQ9JLQ0 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd2apQ9JLQ0 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd2apQ9JLQ0 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd2apQ9JLQ0 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd2apQ9JLQ0 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd2apQ9JLQ0 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd2apQ9JLQ0 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd2apQ9JLQ0 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd2apQ9JLQ0 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd2apQ9JLQ0 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd2apQ9JLQ0 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd2apQ9JLQ0 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd2apQ9JLQ0 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd2apQ9JLQ0 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd2apQ9JLQ0 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd2apQ9JLQ0 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd2apQ9JLQ0 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd2apQ9JLQ0 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd2apQ9JLQ0 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd2apQ9JLQ0 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd2apQ9JLQ0 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd2apQ9JLQ0 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd2apQ9JLQ0 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cd2apQ9JLQ0 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cd2apQ9JLQ0 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cd2apQ9JLQ0 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cd2apQ9JLQ0 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms