Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLL0

Crim1, Cysteine-rich motor neuron 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,037 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crim1Q9JLL0 Gm5941-201ENSMUST00000096371 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Crim1Q9JLL0 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Crim1Q9JLL0 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Crim1Q9JLL0 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Crim1Q9JLL0 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Crim1Q9JLL0 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Crim1Q9JLL0 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Crim1Q9JLL0 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Crim1Q9JLL0 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Crim1Q9JLL0 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Crim1Q9JLL0 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Crim1Q9JLL0 Skint10-201ENSMUST00000060327 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Crim1Q9JLL0 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Crim1Q9JLL0 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Crim1Q9JLL0 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Crim1Q9JLL0 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Crim1Q9JLL0 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Crim1Q9JLL0 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Crim1Q9JLL0 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Crim1Q9JLL0 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Crim1Q9JLL0 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Crim1Q9JLL0 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Crim1Q9JLL0 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Crim1Q9JLL0 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Crim1Q9JLL0 Gm14152-201ENSMUST00000127020 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Crim1Q9JLL0 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Crim1Q9JLL0 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Crim1Q9JLL0 Gm16285-201ENSMUST00000162999 347 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Crim1Q9JLL0 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Crim1Q9JLL0 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Crim1Q9JLL0 Gm28455-201ENSMUST00000189105 1290 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Crim1Q9JLL0 Gm44777-203ENSMUST00000206930 571 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Crim1Q9JLL0 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Crim1Q9JLL0 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Crim1Q9JLL0 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Crim1Q9JLL0 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Crim1Q9JLL0 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Crim1Q9JLL0 Clec4a2-201ENSMUST00000032248 1261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Crim1Q9JLL0 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Crim1Q9JLL0 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Crim1Q9JLL0 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Crim1Q9JLL0 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Crim1Q9JLL0 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Crim1Q9JLL0 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Crim1Q9JLL0 Gm45114-201ENSMUST00000208280 1349 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Crim1Q9JLL0 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Crim1Q9JLL0 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Crim1Q9JLL0 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Crim1Q9JLL0 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Crim1Q9JLL0 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Crim1Q9JLL0 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Crim1Q9JLL0 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Crim1Q9JLL0 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Crim1Q9JLL0 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Crim1Q9JLL0 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Crim1Q9JLL0 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Crim1Q9JLL0 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Crim1Q9JLL0 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Crim1Q9JLL0 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Crim1Q9JLL0 Gm15937-201ENSMUST00000120727 1235 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Crim1Q9JLL0 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Crim1Q9JLL0 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Crim1Q9JLL0 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Crim1Q9JLL0 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Crim1Q9JLL0 Gm23757-201ENSMUST00000158353 100 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Crim1Q9JLL0 Gm4207-201ENSMUST00000173144 960 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Crim1Q9JLL0 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Crim1Q9JLL0 9430037O13Rik-201ENSMUST00000192556 1008 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Crim1Q9JLL0 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Crim1Q9JLL0 Gm42696-201ENSMUST00000199859 1142 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Crim1Q9JLL0 AC154838.2-201ENSMUST00000226602 747 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Crim1Q9JLL0 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Crim1Q9JLL0 Olfr1039-201ENSMUST00000099910 960 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Crim1Q9JLL0 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Crim1Q9JLL0 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Crim1Q9JLL0 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Crim1Q9JLL0 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Crim1Q9JLL0 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Crim1Q9JLL0 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Crim1Q9JLL0 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Crim1Q9JLL0 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Crim1Q9JLL0 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Crim1Q9JLL0 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Crim1Q9JLL0 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Crim1Q9JLL0 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Crim1Q9JLL0 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Crim1Q9JLL0 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC13.83□□□□□ -0.19
Crim1Q9JLL0 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC13.83□□□□□ -0.19
Crim1Q9JLL0 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Crim1Q9JLL0 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Crim1Q9JLL0 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Crim1Q9JLL0 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Crim1Q9JLL0 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Crim1Q9JLL0 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Crim1Q9JLL0 Prl8a6-203ENSMUST00000110355 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Crim1Q9JLL0 Gm14862-201ENSMUST00000115553 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Crim1Q9JLL0 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Crim1Q9JLL0 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Crim1Q9JLL0 Gm14040-201ENSMUST00000139058 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Crim1Q9JLL0 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms