Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL96

Ctsm, Cathepsin M, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsmQ9JL96 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CtsmQ9JL96 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CtsmQ9JL96 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CtsmQ9JL96 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CtsmQ9JL96 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CtsmQ9JL96 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CtsmQ9JL96 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CtsmQ9JL96 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CtsmQ9JL96 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CtsmQ9JL96 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CtsmQ9JL96 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CtsmQ9JL96 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CtsmQ9JL96 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CtsmQ9JL96 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CtsmQ9JL96 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CtsmQ9JL96 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CtsmQ9JL96 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CtsmQ9JL96 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CtsmQ9JL96 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CtsmQ9JL96 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CtsmQ9JL96 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CtsmQ9JL96 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CtsmQ9JL96 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CtsmQ9JL96 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CtsmQ9JL96 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CtsmQ9JL96 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CtsmQ9JL96 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CtsmQ9JL96 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CtsmQ9JL96 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CtsmQ9JL96 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CtsmQ9JL96 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CtsmQ9JL96 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CtsmQ9JL96 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CtsmQ9JL96 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CtsmQ9JL96 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CtsmQ9JL96 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CtsmQ9JL96 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CtsmQ9JL96 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CtsmQ9JL96 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CtsmQ9JL96 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CtsmQ9JL96 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CtsmQ9JL96 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CtsmQ9JL96 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CtsmQ9JL96 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CtsmQ9JL96 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CtsmQ9JL96 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CtsmQ9JL96 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CtsmQ9JL96 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CtsmQ9JL96 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CtsmQ9JL96 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CtsmQ9JL96 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CtsmQ9JL96 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CtsmQ9JL96 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CtsmQ9JL96 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CtsmQ9JL96 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CtsmQ9JL96 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CtsmQ9JL96 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CtsmQ9JL96 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CtsmQ9JL96 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CtsmQ9JL96 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CtsmQ9JL96 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CtsmQ9JL96 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CtsmQ9JL96 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CtsmQ9JL96 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CtsmQ9JL96 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CtsmQ9JL96 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CtsmQ9JL96 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CtsmQ9JL96 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CtsmQ9JL96 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CtsmQ9JL96 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CtsmQ9JL96 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CtsmQ9JL96 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CtsmQ9JL96 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CtsmQ9JL96 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CtsmQ9JL96 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CtsmQ9JL96 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CtsmQ9JL96 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CtsmQ9JL96 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CtsmQ9JL96 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CtsmQ9JL96 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CtsmQ9JL96 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CtsmQ9JL96 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CtsmQ9JL96 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CtsmQ9JL96 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CtsmQ9JL96 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CtsmQ9JL96 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CtsmQ9JL96 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CtsmQ9JL96 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CtsmQ9JL96 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CtsmQ9JL96 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CtsmQ9JL96 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CtsmQ9JL96 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CtsmQ9JL96 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CtsmQ9JL96 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CtsmQ9JL96 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CtsmQ9JL96 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CtsmQ9JL96 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CtsmQ9JL96 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CtsmQ9JL96 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CtsmQ9JL96 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms