Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL56

Gde1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gde1Q9JL56 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gde1Q9JL56 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gde1Q9JL56 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gde1Q9JL56 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gde1Q9JL56 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gde1Q9JL56 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gde1Q9JL56 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gde1Q9JL56 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gde1Q9JL56 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gde1Q9JL56 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gde1Q9JL56 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gde1Q9JL56 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gde1Q9JL56 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gde1Q9JL56 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gde1Q9JL56 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gde1Q9JL56 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gde1Q9JL56 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gde1Q9JL56 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gde1Q9JL56 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gde1Q9JL56 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gde1Q9JL56 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gde1Q9JL56 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gde1Q9JL56 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gde1Q9JL56 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gde1Q9JL56 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gde1Q9JL56 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gde1Q9JL56 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gde1Q9JL56 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gde1Q9JL56 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gde1Q9JL56 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gde1Q9JL56 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gde1Q9JL56 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gde1Q9JL56 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gde1Q9JL56 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gde1Q9JL56 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gde1Q9JL56 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gde1Q9JL56 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gde1Q9JL56 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gde1Q9JL56 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gde1Q9JL56 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gde1Q9JL56 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gde1Q9JL56 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gde1Q9JL56 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gde1Q9JL56 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gde1Q9JL56 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gde1Q9JL56 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gde1Q9JL56 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gde1Q9JL56 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gde1Q9JL56 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gde1Q9JL56 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gde1Q9JL56 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gde1Q9JL56 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gde1Q9JL56 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gde1Q9JL56 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gde1Q9JL56 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gde1Q9JL56 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gde1Q9JL56 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gde1Q9JL56 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gde1Q9JL56 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gde1Q9JL56 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gde1Q9JL56 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gde1Q9JL56 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gde1Q9JL56 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gde1Q9JL56 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gde1Q9JL56 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gde1Q9JL56 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gde1Q9JL56 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gde1Q9JL56 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gde1Q9JL56 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gde1Q9JL56 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gde1Q9JL56 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gde1Q9JL56 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gde1Q9JL56 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gde1Q9JL56 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gde1Q9JL56 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gde1Q9JL56 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gde1Q9JL56 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gde1Q9JL56 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gde1Q9JL56 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gde1Q9JL56 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gde1Q9JL56 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gde1Q9JL56 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gde1Q9JL56 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gde1Q9JL56 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gde1Q9JL56 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gde1Q9JL56 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gde1Q9JL56 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gde1Q9JL56 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gde1Q9JL56 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gde1Q9JL56 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gde1Q9JL56 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gde1Q9JL56 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gde1Q9JL56 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gde1Q9JL56 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gde1Q9JL56 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gde1Q9JL56 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gde1Q9JL56 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gde1Q9JL56 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gde1Q9JL56 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gde1Q9JL56 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms